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01.12.2014 | Brief Report | Ausgabe 12/2014

Archives of Virology 12/2014

Comparative analysis of LTR and structural genes in an equine infectious anemia virus strain isolated from a feral horse in Japan

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 12/2014
Autoren:
Jianbao Dong, Frank R. Cook, Takeshi Haga, Yoichiro Horii, Junzo Norimine, Naoaki Misawa, Yoshitaka Goto, Wei Zhu
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.​1007/​s00705-014-2206-0) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Abstract

Although equine infectious anemia virus (EIAV) poses a major threat to the equine industry worldwide, the molecular epidemiology of this virus is poorly understood. Recently, an EIAV strain (EIAVMiyazaki2011-A) representing a new monophyletic group was discovered in feral horses in southern Japan. In the present study, the EIAVMiyazaki2011-A proviral genome is compared with evolutionarily divergent EIAV isolates to investigate conservation of functional elements or motifs within the long terminal repeats (LTRs) and structural genes. This analysis represents a significant step forward in increasing understanding of the molecular conservation and variation between geographically distinct strains of this equine lentivirus.

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Literatur
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