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01.12.2014 | Annotated Sequence Record | Ausgabe 12/2014

Archives of Virology 12/2014

Complete genome analysis of a novel recombinant isolate of potato virus Y from China

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 12/2014
Autoren:
Fangluan Gao, Fei Chang, Jianguo Shen, Fengyang Shi, Lianhui Xie, Jiasui Zhan
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.​1007/​s00705-014-2184-2) contains supplementary material, which is available to authorized users.
F. Gao and F. Chang contributed equally to this work.

Abstract

The complete sequence of GF_YL20, a potato virus Y (PVY) isolate from China, encodes a polyprotein of 3,061 amino acids. Sequence analysis indicates that GF_YL20 has a genomic structure different from previously reported PVY strains. It shares 99 % nucleotide sequence identity with PB209 (PVYN:O) except in VPg, but more than 97 % nucleotide sequence identity with the VPg of Mont (PVYN), PB312 (PVYNTN) and HN2 (SYR-I). Phylogenetic analysis indicates that GF_YL20 is a novel N:O recombinant with three recombination breakpoints.

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Fig. S1 Disease symptoms induced by GF_YL20 on potato (PDF 33 kb)
705_2014_2184_MOESM1_ESM.pdf
Fig. S2 Recombination analysis of the PVY GF_YL20 isolate by Simplot using PVYO (Oz), PVYN (Mont) and PVYN:O (PB209) as references. RJ1-RJ3 are the putative recombination breakpoints. (PDF 223 kb)
705_2014_2184_MOESM2_ESM.pdf
Literatur
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