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Complete genome sequence and genome organization of Ficus pumila-associated virus, a new putative member of the family Tymoviridae

  • 01.06.2025
  • Annotated Sequence Record
Erschienen in:

Abstract

Ficus pumila is an edible garden plant with significant medicinal value. In this study, we identified a novel maculavirus associated with mosaic and chlorotic spot symptoms on F. pumila leaves in Yunnan Province, China, and the genome sequence of the virus, which was tentatively named "Ficus pumila-associated virus" (FPaV), was determined. The FPaV genome consists of a single molecule of positive-sense ssRNA that is 6,664 nucleotides in length and has a high cytidine content of 40.8%. The genome exhibits a tymovirus-like organization, encoding a movement protein (MP), a replicase polyprotein, and a coat protein (CP). Phylogenetic analysis showed FPaV to be most closely related to grapevine fleck virus (GFkV), with 67.86% nucleotide sequence identity across the complete genome.
Titel
Complete genome sequence and genome organization of Ficus pumila-associated virus, a new putative member of the family Tymoviridae
Verfasst von
Mengze Guo
Pingping Sun
Xudong Fan
Jianwei Guo
Lei Zhang
Zhengnan Li
Publikationsdatum
01.06.2025
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 6/2025
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-025-06312-7
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