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01.03.2012 | Annotated Sequence Record | Ausgabe 3/2012

Archives of Virology 3/2012

Complete genomic sequence analysis reveals a novel fabavirus infecting cucurbits in China

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 3/2012
Autoren:
Shu-Wei Dong, Hai-Ying Xiang, Qiao-Xia Shang, Da-Wei Li, Jia-Lin Yu, Cheng-Gui Han
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.​1007/​s00705-011-1202-x) contains supplementary material, which is available to authorized users.
S.-W. Dong and H.-Y. Xiang contributed equally to this work.

Abstract

The complete genome sequence of a cucurbit-infecting fabavirus was determined. Sequence analysis revealed that it had a genomic organization typical of fabaviruses, with genome segment sizes of 5870 nt (RNA-1) and 3294 nt (RNA-2). It shared CP and Pro-Pol amino acid sequence identities of 52.0–58.9% with those of reported fabaviruses. ELISA and western blots gave no cross-reactions between this cucurbit virus and broad bean wilt viruses 1 and 2. Based on molecular and serological criteria for species demarcation in the genus Fabavirus, the virus represents a distinct species, for which the species name Cucurbit mild mosaic virus (CuMMV) is proposed.

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