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12.02.2019 | Annotated Sequence Record | Ausgabe 4/2019 Open Access

Archives of Virology 4/2019

Complete nucleotide sequence of a novel mycovirus from Trichoderma harzianum in China

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 4/2019
Autoren:
Chenchen Liu, Mei Li, Estifanos Tsegaye Redda, Jie Mei, Jiantai Zhang, Santiago F. Elena, Beilei Wu, Xiliang Jiang
Wichtige Hinweise
Handling Editor: Robert H. A. Coutts.

Electronic supplementary material

The online version of this article (https://​doi.​org/​10.​1007/​s00705-019-04145-9) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Chenchen Liu and Mei Li: Contribute equally as first authors.

Publisher's Note

Springer Nature remains neutral with regard to jurisdictional claims in published maps and institutional affiliations.

Abstract

A new mycovirus was identified in Trichoderma harzianum strain 137 isolated in Xinjiang province, China. The whole genome sequence of the mycovirus was determined by metagenomic sequencing, RT-PCR, and RACE cloning. The mycovirus contained two genomic segments. The first segment was 2088 bp long and contained a single ORF (ORF1) encoding the RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) (72.26 kDa). The second segment was 1634 bp long and also contained a single ORF (ORF2) encoding a hypothetical protein of 37.472 kDa. We named this novel mycovirus “Trichoderma harzianum bipartite mycovirus 1” (ThBMV1). Phylogenetic analysis showed that ThBMV1 clusters with other unclassified dsRNA mycoviruses.

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