Skip to main content
main-content

19.05.2017 | Brief Report | Ausgabe 9/2017

Archives of Virology 9/2017

Complete sequence and genomic annotation of carrot torradovirus 1

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 9/2017
Autoren:
Zuriñe Rozado-Aguirre, Ian Adams, Adrian Fox, Matthew Dickinson, Neil Boonham
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.​1007/​s00705-017-3410-5) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Abstract

Carrot torradovirus 1 (CaTV1) is a new member of the genus Torradovirus within the family Secoviridae. CaTV1 genome sequences were obtained from a previous next-generation sequencing (NGS) study and were compared to other members and tentative new members of the genus. The virus has a bipartite genome, and RACE was used to amplify and sequence each end of RNA1 and RNA2. As a result, RNA1 and RNA2 are estimated to contain 6944 and 4995 nucleotides, respectively, with RNA1 encoding the proteins involved in virus replication, and RNA2 encoding the encapsidation and movement proteins. Sequence comparisons showed that CaTV1 clustered within the non-tomato-infecting torradoviruses and is most similar to motherwort yellow mottle virus (MYMoV). The nucleotide sequence identities of the Pro-Pol and coat protein regions were below the criteria established by the ICTV for demarcating species, confirming that CaTV1 should be classified as a member of a new species within the genus Torradovirus.

Bitte loggen Sie sich ein, um Zugang zu diesem Inhalt zu erhalten

★ PREMIUM-INHALT
e.Med Interdisziplinär

Mit e.Med Interdisziplinär erhalten Sie Zugang zu allen CME-Fortbildungen und Fachzeitschriften auf SpringerMedizin.de. Zusätzlich können Sie eine Zeitschrift Ihrer Wahl in gedruckter Form beziehen – ohne Aufpreis.

Bis zum 22.10. bestellen und 100 € sparen!

Weitere Produktempfehlungen anzeigen
Zusatzmaterial
Supplementary material 1 (DOCX 24 kb)
705_2017_3410_MOESM1_ESM.docx
Literatur
Über diesen Artikel

Weitere Artikel der Ausgabe 9/2017

Archives of Virology 9/2017Zur Ausgabe
  1. Das kostenlose Testabonnement läuft nach 14 Tagen automatisch und formlos aus. Dieses Abonnement kann nur einmal getestet werden.

  2. Das kostenlose Testabonnement läuft nach 14 Tagen automatisch und formlos aus. Dieses Abonnement kann nur einmal getestet werden.

Neu im Fachgebiet Innere Medizin

 

 

 
 

Meistgelesene Bücher aus der Inneren Medizin

2017 | Buch

Rheumatologie aus der Praxis

Entzündliche Gelenkerkrankungen – mit Fallbeispielen

Dieses Fachbuch macht mit den wichtigsten chronisch entzündlichen Gelenk- und Wirbelsäulenerkrankungen vertraut. Anhand von über 40 instruktiven Fallbeispielen werden anschaulich diagnostisches Vorgehen, therapeutisches Ansprechen und der Verlauf …

Herausgeber:
Rudolf Puchner

2016 | Buch

Ambulant erworbene Pneumonie

Was, wann, warum – Dieses Buch bietet differenzierte Diagnostik und Therapie der ambulant erworbenen Pneumonie zur sofortigen sicheren Anwendung. Entsprechend der neuesten Studien und Leitlinien aller wichtigen Fachgesellschaften.

Herausgeber:
Santiago Ewig

Mail Icon II Newsletter

Bestellen Sie unseren kostenlosen Newsletter Update Innere Medizin und bleiben Sie gut informiert – ganz bequem per eMail.

© Springer Medizin 

Bildnachweise