Acknowledgements
We wish to thank all the patients and staff from all the units that participated in the study, and the ANRS-MIE (Agence Nationale de Recherches sur le SIDA et les hépatites virales- Maladies Infectieuses Emergentes) for its support. CoCliCo study group: Guillaume Martin-Blondel1,2, Pierre Delobel1, Gaspard Grouteau1, Jean Roch Le Henaff1, Vincent Mear1, Sandra Lagarrigues1, Alais Frelat1,Thomas De Nadai14, Zara Steinmeyer14, Arnaud Del Bello15, Stéphanie Ruiz16, Benjamine Sarton16, Elise Noel-Savina17, Jacques Izopet18, Nathan Peiffer-Smadja3, Michael Thy3, Mathilde Gare3, Diane Le Pluart3, François-Xavier Lescure3, Christophe Rioux3, Laurène Deconinck3, Yazdan Yazdanpanah3, BenoitVisseaux3, Diane Descamps5, Charlotte Charpentier5, Jean-Marc Chapplain6, Pierre Tattevin6, Thomas Perpoint7, Maude Bouscambert-Duchamp19, Hodane Yonis20, Paul Chabert20, Hugues Cordel8, Youssouf Mohamed-Kassim8, Nolan Hassold8, Segolène Brichler21, Julien Caliez22, Thomas Rambaud23, Marilucy Lopez-Sublet24, Frédéric Adnet25, Gilles Pialoux9, Christia Palacios9, Marwa bachir9, Marine Nadal9, Mathieu turpin26, Antoine Parrot27, Djeneba Fofana28, Jérome Pacanowski10, Karine Lacombe10, Emmanuelle Gras10, Laura Levi10, Laure Surgers10, Ines Devred10, Nadia Valin10, Thibault Chiarabini10, Jean Luc Meynard10, Adeline Bauvois11, Clara Duran11, Elyanne Gault11, Jean-Emmanuel Kahn11, Elisabeth Rouveix11, Guillaume Geri29, Didier laureillard12, Albert Sotto12, Paul Loubet12, Claire Roger30, Julien Poissy13, Marc Lambert13, Ady Assaf31, Laurence Bocket32, Firouzé Bani-Sadr33, Yohan N'Guyen33, Juliette Romaru33, Maxime Hentzien33, Thomas Gabas34, Amélie Chabrol34, Cecilia Billiou35, Philippe Menager36, Christophe Billy37, Jean-Jacques Laurichesse37, Fabrice Ketty N Simba37, Pauline Caraux Paz38, Liliane Tinang39, Agathe Bounhiol39, Catherine Burnat40, Sandrine Soriot-Thomas41, Damien Basille41, Jean Philippe Lanoix41, Yoan Zerbib41, Yoann Zerbib41, Anne Pouvaret42, Fanny Lanternier42, Helene Mascitti43, Aurélien Dinh43, Benjamin Davido43, Hôpital Foch, Suresnes, France, Service de Biologie Clinique : Philippe Lesprit44, Eric Farfour44, Mathilde Neuville45, Linda Nait Allaoua46, Michèle Lejaille46, Nathalie De Castro47, Jean-Michel Molina47, Diane Ponscarme47, Mariagrazia Tateo47, Geoffroy Liegeon47, Ines Boussen47, Pauline Huriez47, André Cabié48, Valentine Campana48, Isabelle Calmont48, Jean-Marie Turmel48, Guitteaud Karine48, Pierre-François Sandrine48, Athéna Marquise48, Ornella Cabras48, Mélanie Lehoux48, Cyrille Chabartier49, Vincent Dubee50, Diama Ndiaye50, Caroline Lefeuvre51, Achille Kouatchet52, Duc Nguyen53, Camille Tumiotto54, Pierre Sioniac55, Alexandre Boyer55, Jean-François Faucher56, Edouard Desvaux57, Sylvie Rogez58, Paul Le Turnier59, François Raffi59, Emmanuel Canet60, Antoine Roquilly60, Louise Castain61, Solène Secher61, Véronique Mondain62, Lionel Piroth63, Christelle Auvray64, Pascal Chavanet64, Marielle Buisson64, Sophie Mahy64, François-Xavier Catherine64, Clementine Esteve64, Michel Duong64, Carole Charles64, Sandrine Gohier64, Céline Schaffer65, Olivier Robineau66, Perrine Bortolotti66, Maxime Pradier66, Francois Goehringer67, Alice Corbel67, Jeanne Kotzyba67, Kévin Alexandre68, Gaetan Beduneau69, Elodie Alessandri-Gradt70, Martin Martinot71, Simon Gravier71, Ciprian Ion71, Victoire de Lastours72, Roza Rahli72, Valérie Garrait73, Laurent Richier73, Mounira Smati-lafarge74, Guillemette Frémont75, Pierre Louis Nivose75, Marie Hélène André75, Magdalena Gerin75, Aicha Hamdi76, Naomi Sayre77, Stephanie Cossec77, Sophie Alviset77, Pierre Alain Billy77, Marie Gousseff78, Emmanuel Forestier79, Anne-Laure Destrem79, Olivier Rogeaux79, Alexie Bosch79, Sabrina Bryant79, Gaëlle Bourgeois79, Ophélie Dos Santos Schaller79, Marie-Christine Carret79, Nicolas Ettahar80, Haciba Moudjahed81, Nathalie Leone82, Mehdi Djennaoui83, Nicolas Lefebvre84, Axel Ursenbach84, François Danion84, Yvon Ruch84, Morgane Solis85, Hamid Merdji86, Loïc Kassègne87, Fanny Pommeret88, Emeline Colomba Blameble88, Merad Manssouria89, Annabelle Stoclin89, Franck Griscelli90, Sophie Deriaz91, Eric Oziol91, Laurent Favier91, Julien Obiols91, Pascal Gicquel92, Christophe Rapp93, Laurence Louvet93, Paul Ihout93, Jean-Benoit Zabbé94, Laurent Bellec95, Tomasz Chroboczek96, Sandrine Mégessier96, Marie Lacoste96, Benjamin Viala96, Thibaut Challan-Belval96, Chloé Wackenheim96, Paule Letertre-Gibert96,Olivier
Grossi97
1Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Toulouse, France; 2Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), INSERM UMR1291—CNRS UMR5051—Université Toulouse III, Toulouse, France; 3Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Bichat-Claude-Bernard, APHP, Paris, France; 4Sorbonne Université, INSERM, Institut Pierre Louis d’Épidémiologie et de Santé Publique (IPLESP), Paris, France; 5Service de Virologie, Université de Paris, INSERM, IAME, UMR 1137, AP-HP, Hôpital Bichat-Claude Bernard, F-75018 Paris, France; 6Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Rennes, Rennes, France; 7Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France; 8Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Avicenne, AP-HP, Bobigny, France; 9Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Tenon, APHP, Paris, France; 10Service des Maladies infectieuses et tropicales, Hôpital Saint-Antoine, APHP, Paris, France; 11Service de Médecine Interne, Hôpital Ambroise Paré, APHP, Boulogne-Billancourt, France; 12Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes, Nîmes, France; 13Univ. Lille, Inserm U1285, CHU Lille, Pôle de médecine intensive réanimation, CNRS, UMR 8576—UGSF—Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle, F-59000 Lille, France; 14Départmement de Gériatrie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Toulouse, France; 15Département de Néphrologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Toulouse, France; 16Service de Réanimation, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Toulouse, France; 17Servivce de Pneumologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Toulouse, France; 18Laboratoire de Virologie, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Toulouse, France; 19Laboratoire de Virologie, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France; 20Service de Réanimation, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France; 21Laboratoire de Virologie, Hôpital Avicenne, AP-HP, Bobigny, France; 22Service de Pneumologie, Hôpital Avicenne, AP-HP, Bobigny, France; 23Service de Réanimation, Hôpital Avicenne, AP-HP, Bobigny, France; 24Service de Médecine Interne, Hôpital Avicenne, AP-HP, Bobigny, France; 25Service des Urgences et SAMU 93, Hôpital Avicenne, AP-HP, Bobigny, France; 26Service de Réanimation, Hôpital Tenon, APHP, Paris, France; 27Service de Pneumologie, Hôpital Tenon, APHP, Paris, France; 28Laboratoire de Virologie, Hôpital Tenon, APHP, Paris, France; 29Service de Réanimation, Hôpital Ambroise Paré, APHP, Boulogne-Billancourt, France; 30Service de Réanimation, Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes, Nîmes, France; 31Service des Maladies Infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Lille, Lille, France; 32Laboratoire de Virologie, Centre Hospitalier Universitaire de Lille, Lille, France; 33Service des Maladies Infectieuses, CHU de Reims, Reims, France; 34Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Sud Francilien, Corbeil, France; 35Service de Réanimation, Centre Hospitalier Sud Francilien, Corbeil, France; 36Service de Pneumologie, Centre Hospitalier Sud Francilien, Corbeil, France; 37Service de Médecine Interne, CH François Quesnay, Mantes, France; 38Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital intercommunal, Villeneuve St George, France; 39Centre de Recherche Clinique, Hôpital intercommunal, Villeneuve St George, France; 40Unité d'hygiène, Hôpital intercommunal, Villeneuve St George, France; 41Centre de Recherches Cliniques CHU Amiens Picardie, Amiens, France; 42Service des Maladies Infectieuses, APHP Hôpital Necker, Paris, France; 43Service de Dermatologie et vénérologie, APHP Hôpital Raymond Poincaré, Garches, France; 44Service de Biologie Clinique, Hôpital Foch, Suresnes, France; 45Service de Réanimation, Hôpital Foch, Suresnes, France; 46Délégation à la Recherche Clinique et à l'Innovation, Hôpital Foch, Suresnes, France; 47Service des Maladies Infectieuses, Hôpital St Louis, Paris, France; 48Inserm CIC 1424, CHU de Martinique, Fort de France, France; 49Service de Réanimation, CHU de Martinique, Fort de France, France; 50Service des Maladies Infectieuses, Hôpital Universtiaire, Angers, France; 51Laboratoire de Virologie, Hôpital Universtiaire, Angers, France ; 52Service de réanimation, Hôpital Universtiaire, Angers, France; 53Service de Maladies Infectieuses et Tropicales , CHU Bordeaux, Bordeaux, France; 54Laboratoire de Virologie, CHU Bordeaux, Bordeaux, France; 55Service de Réanimation, CHU Bordeaux, Bordeaux, France; 56Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, CHU Limoges, Limoges, France ; 57Service de Gériatrie, CHU Limoges, Limoges, France ; 58Laboratoire de Virologie, CHU Limoges, Limoges, France; 59Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Hôtel-Dieu, Nantes, France; 60Service de Réanimation, Hôpital Hôtel-Dieu, Nantes, France; 61Laboratoire de virologie, Hôpital Hôtel-Dieu, Nantes, France; 62Service d'Infectiologie, Hôpital de l'Archet, CHU de Nice, Hôpital de l'Archet, Nice, France; 63Département d'infectiologie, CHU Dijon, Bourgogne, Dijon, France; 64Laboratoire de Virologie : CHU Dijon, Bourgogne, Dijon, France; 65Pole de Biologie, CHU Dijon, Bourgogne, Dijon, France; 66Service Universitaire des Maladies Infectieuses, Centre hospitalier de Tourcoing, Tourcoing, France; 67Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy, Vandoeuvre lès Nancy, France; 68Service des Maladies Infectieuses, CHU Rouen, Rouen, France; 69Service de Réanimation, CHU Rouen, Rouen, France; 70Laboratoire de Virologie, CHU Rouen, Rouen, France; 71Service de Maladies Infectieuses et Tropicales Hôpitaux Civils de Colmar, Colmar, France; 72Service de Médecine Interne, APHP, Hôpital Beaujon, Clichy, France; 73Service de Médecine Interne, Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil, Créteil, France; 74Laboratoire de Microbiologie Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil, Créteil, France; 75Service de Médecine Interne et Maladies Infectieuses, Centre Hospitalier Intercomunal André Grégoire, Montreuil, France; 76Service de Réanimation, Centre Hospitalier Intercomunal André Grégoire, Montreuil, France; 77Service de Maladies Infectieuses et Tropicales , CH Saint Denis, St Denis, France; 78Service de Médecine Interne, Centre Hospitalier Bretagne Atlantique, Vannes, France; 79Service des Maladies Infectieuses, Centre Hospitalier Métropole Savoie, Chambéry, France; 80Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier de Valenciennes, Valenciennes, France ; 81Laboratoire de biologie médicale, Centre Hospitalier de Valenciennes, Valenciennes, France; 82Unité de recherche clinique, Centre Hospitalier de Valenciennes, Valenciennes, France; 83Département d'information médicale, Centre Hospitalier de Valenciennes, Valenciennes, France; 84Service des Maladies infectieuses, Hôpitaux Universitaires de Starsbourg, Strastbourg, France ; 85Laboratoire de Virologie, Hôpitaux Universitaires de Starsbourg, Strastbourg, France ; 86Service de Réanimation, Hôpitaux Universitaires de Starsbourg, Strastbourg, France ; 87Service de Pneumologie, Hôpitaux Universitaires de Starsbourg, Strastbourg, France; 88Département d'Oncologie Médicale, Gustave Roussy Cancer Campus, Villejuif, France; 89Service de Réanimation, Gustave Roussy Cancer Campus, Villejuif, France ; 90Laboratoire de Virologie, Gustave Roussy Cancer Campus, Villejuif, France ; 91Service de Médecine Interne, Infectiologie Centre Hospitalier de Béziers, Béziers, France; 92Service de Médecine Polyvalente, Centre
Hospitalier de Châteaubriant, France; 93Service de Médecine Interne, Hopital Américain de Paris, Neuilly sur Seine, France ; 94Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre hospitalier de Périgueux, Périgueux, France; 95Service d'Infectiologie, Centre Hospitalier du Centre Bretagne, Pontivy, France; 96Service de Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Alpes Leman, Contamine sur Arve, France; 97Service de Médecine Interne et Infectiologie, Hôpital Privé du Confluent, Nantes, France