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Erschienen in:

01.10.2007 | Leitthema

Protein-Mikroarrays

verfasst von: PD Dr. F. von Eggeling, C. Melle

Erschienen in: Die Onkologie | Ausgabe 10/2007

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Zusammenfassung

Proteinbasierende Mikroarray-Systeme finden in der onkologischen Diagnostik zunehmend Verwendung. Der vorliegende Beitrag soll einen Überblick über die verschiedenen Systeme geben. Für die Diagnostik werden meist analytische Chip-Systeme verwendet, bei denen verschiedene Antikörper in hoher Dichte auf einen Träger gebunden sind. An diese Antikörper können entsprechende Proteine aus einer Patientenprobe ankoppeln und anschließend quantitativ durch ein Farbsignal nachgewiesen werden. Zusätzlich zu diesen analytischen Antikörperarrays kommen auch Chip-Systeme zum Einsatz, bei denen Proteine an ein Trägermaterial gebunden werden, um Antikörper nachzuweisen und um Protein-Protein-Interaktionen zu bestimmen. Auch proteinbindende Oberflächen in Kombination mit Massenspektrometrie können für die Analyse von Proteinen eingesetzt werden. Allen Systemen ist gemeinsam, dass in einem Ansatz eine Vielzahl von Proteinen analysiert werden kann. Durch die bestehende Möglichkeit der Miniaturisierung ist eine zukünftige Anwendung auch in der Point-of-Care-Diagnostik zu sehen.
Literatur
1.
Zurück zum Zitat Bertucci F, Birnbaum D, Goncalves A (2006) Proteomics of breast cancer: principles and potential clinical applications. Mol Cell Proteomics 5: 1772–1786PubMedCrossRef Bertucci F, Birnbaum D, Goncalves A (2006) Proteomics of breast cancer: principles and potential clinical applications. Mol Cell Proteomics 5: 1772–1786PubMedCrossRef
2.
Zurück zum Zitat Casiano CA, Mediavilla-Varela M, Tan EM (2006) Tumor-associated antigen arrays for the serological diagnosis of cancer. Mol Cell Proteomics 5: 1745–1759PubMedCrossRef Casiano CA, Mediavilla-Varela M, Tan EM (2006) Tumor-associated antigen arrays for the serological diagnosis of cancer. Mol Cell Proteomics 5: 1745–1759PubMedCrossRef
3.
Zurück zum Zitat Celis JE, Moreira JM, Cabezon T et al. (2005) Identification of extracellular and intracellular signaling components of the mammary adipose tissue and its interstitial fluid in high risk breast cancer patients: toward dissecting the molecular circuitry of epithelial-adipocyte stromal cell interactions. Mol Cell Proteomics 4: 492–522PubMedCrossRef Celis JE, Moreira JM, Cabezon T et al. (2005) Identification of extracellular and intracellular signaling components of the mammary adipose tissue and its interstitial fluid in high risk breast cancer patients: toward dissecting the molecular circuitry of epithelial-adipocyte stromal cell interactions. Mol Cell Proteomics 4: 492–522PubMedCrossRef
4.
Zurück zum Zitat Cho WC, Yip TT, Yip C et al. (2004) Identification of serum amyloid a protein as a potentially useful biomarker to monitor relapse of nasopharyngeal cancer by serum proteomic profiling. Clin Cancer Res 10: 43–52PubMedCrossRef Cho WC, Yip TT, Yip C et al. (2004) Identification of serum amyloid a protein as a potentially useful biomarker to monitor relapse of nasopharyngeal cancer by serum proteomic profiling. Clin Cancer Res 10: 43–52PubMedCrossRef
5.
Zurück zum Zitat Escher N, Kaatz M, Melle C et al. (2007) Posttranslational modifications of transthyretin are serum markers in patients with mycosis fungoides. Neoplasia 9: 254–259PubMedCrossRef Escher N, Kaatz M, Melle C et al. (2007) Posttranslational modifications of transthyretin are serum markers in patients with mycosis fungoides. Neoplasia 9: 254–259PubMedCrossRef
6.
Zurück zum Zitat FitzGerald SP, Lamont JV, McConnell RI et al. (2005) Development of a high-throughput automated analyzer using biochip array technology. Clin Chem 51: 1165–1176PubMedCrossRef FitzGerald SP, Lamont JV, McConnell RI et al. (2005) Development of a high-throughput automated analyzer using biochip array technology. Clin Chem 51: 1165–1176PubMedCrossRef
7.
Zurück zum Zitat Fung ET, Yip TT, Lomas L et al. (2005) Classification of cancer types by measuring variants of host response proteins using SELDI serum assays. Int J Cancer 115: 783–789PubMedCrossRef Fung ET, Yip TT, Lomas L et al. (2005) Classification of cancer types by measuring variants of host response proteins using SELDI serum assays. Int J Cancer 115: 783–789PubMedCrossRef
8.
Zurück zum Zitat Hudelist G, Pacher-Zavisin M, Singer CF et al. (2004) Use of high-throughput protein array for profiling of differentially expressed proteins in normal and malignant breast tissue. Breast Cancer Res Treat 86: 281–291PubMedCrossRef Hudelist G, Pacher-Zavisin M, Singer CF et al. (2004) Use of high-throughput protein array for profiling of differentially expressed proteins in normal and malignant breast tissue. Breast Cancer Res Treat 86: 281–291PubMedCrossRef
9.
Zurück zum Zitat Junker K, von Eggeling F, Muller J et al. (2006) Identification of biomarkers and therapeutic targets for renal cell cancer using ProteinChip technology. Urologe 45: 305–315PubMedCrossRef Junker K, von Eggeling F, Muller J et al. (2006) Identification of biomarkers and therapeutic targets for renal cell cancer using ProteinChip technology. Urologe 45: 305–315PubMedCrossRef
10.
Zurück zum Zitat Kricka LJ, Master SR, Joos TO et al. (2006) Current perspectives in protein array technology. Ann Clin Biochem 43: 457–467PubMedCrossRef Kricka LJ, Master SR, Joos TO et al. (2006) Current perspectives in protein array technology. Ann Clin Biochem 43: 457–467PubMedCrossRef
11.
Zurück zum Zitat Liotta LA, Espina V, Mehta AI et al. (2003) Protein microarrays: meeting analytical challenges for clinical applications. Cancer Cell 3: 317–325PubMedCrossRef Liotta LA, Espina V, Mehta AI et al. (2003) Protein microarrays: meeting analytical challenges for clinical applications. Cancer Cell 3: 317–325PubMedCrossRef
12.
Zurück zum Zitat Melle C, Ernst G, Schimmel B et al. (2005) Discovery and identification of alpha-defensins as low abundant, tumor-derived serum markers in colorectal cancer. Gastroenterology 129: 66–73PubMedCrossRef Melle C, Ernst G, Schimmel B et al. (2005) Discovery and identification of alpha-defensins as low abundant, tumor-derived serum markers in colorectal cancer. Gastroenterology 129: 66–73PubMedCrossRef
13.
Zurück zum Zitat Tolson J, Bogumil R, Brunst E et al. (2004) Serum protein profiling by SELDI mass spectrometry: detection of multiple variants of serum amyloid alpha in renal cancer patients. Lab Invest 84: 845–856PubMedCrossRef Tolson J, Bogumil R, Brunst E et al. (2004) Serum protein profiling by SELDI mass spectrometry: detection of multiple variants of serum amyloid alpha in renal cancer patients. Lab Invest 84: 845–856PubMedCrossRef
14.
Zurück zum Zitat van’t Veer LJ, Dai HY, van de Vijver MJ et al. (2002) Gene expression profiling predicts clinical outcome of breast cancer. Nature 415: 530–536CrossRef van’t Veer LJ, Dai HY, van de Vijver MJ et al. (2002) Gene expression profiling predicts clinical outcome of breast cancer. Nature 415: 530–536CrossRef
15.
Zurück zum Zitat von Eggeling F, Melle C, Ernst G (2003) Biomarker discovery by tissue microdissection and ProteinChip Array analysis. J Lab Med 27: 79–84CrossRef von Eggeling F, Melle C, Ernst G (2003) Biomarker discovery by tissue microdissection and ProteinChip Array analysis. J Lab Med 27: 79–84CrossRef
16.
Zurück zum Zitat Weissenstein U, Schneider MJ, Pawlak M et al. (2006) Protein chip based miniaturized assay for the simultaneous quantitative monitoring of cancer biomarkers in tissue extracts. Proteomics 6: 1427–1436PubMedCrossRef Weissenstein U, Schneider MJ, Pawlak M et al. (2006) Protein chip based miniaturized assay for the simultaneous quantitative monitoring of cancer biomarkers in tissue extracts. Proteomics 6: 1427–1436PubMedCrossRef
17.
Zurück zum Zitat Zhang Z, Bast RC Jr, Yu Y et al. (2004) Three biomarkers identified from serum proteomic analysis for the detection of early stage ovarian cancer. Cancer Res 64: 5882–5890PubMedCrossRef Zhang Z, Bast RC Jr, Yu Y et al. (2004) Three biomarkers identified from serum proteomic analysis for the detection of early stage ovarian cancer. Cancer Res 64: 5882–5890PubMedCrossRef
Metadaten
Titel
Protein-Mikroarrays
verfasst von
PD Dr. F. von Eggeling
C. Melle
Publikationsdatum
01.10.2007
Verlag
Springer-Verlag
Erschienen in
Die Onkologie / Ausgabe 10/2007
Print ISSN: 2731-7226
Elektronische ISSN: 2731-7234
DOI
https://doi.org/10.1007/s00761-007-1256-2

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