Fragmentlängenanalyse
Fragmentlängenanalyse
Synonym(e)
DNA-Längenbestimmung
Englischer Begriff
fragment length analysis
Definition
Die Fragmentlängenanalyse ist eine Methode, über eine präzise Ermittlung der Länge eines DNA-Fragments qualitative oder quantitative Hinweise zu kleineren Insertionen oder Duplikationen in einem diagnostisch relevanten DNA-Abschnitt zu bekommen.
Beschreibung
Zur Vorgehensweise der Fragmentlängenanalyse werden PCR-Rektionen zu den relevanten DNA-Abschnitten mit einem fluoreszenzmarkierten Primer im Reaktionsansatz durchgeführt. Anschließend werden die denaturierten, einzelsträngigen PCR-Produkte mittels Kapillarelektrophorese detektiert und die Fragmentlängen anhand der eingesetzten Standards mit einem spezifischen Software-Programm ermittelt.
Die Methode der Fragmentlängenanalyse wird zunehmend eingesetzt, wie beispielsweise bei Repeaterkrankungen (fragiles X-Syndrom oder Chorea Huntington), zur MLPA-Analyse zwecks Ausschluss von intragenischen Duplikationen oder Insertionen, zur Klonalitätstestung in der Hämatoonkologie oder zum DNA-Fingerprinting in der Forensik.
Literatur
De Bellis G et al (1997) Apolipoprotein E genotyping by capillary electrophoretic analysis of restriction fragments. Clin Chem 43:1321–1324PubMed