Organische Verbindungen liefern in der Massenspektrometrie ein charakteristisches Intensitätsmuster, das auf der unterschiedlichen Häufigkeit der Isotope eines Elements beruht. So kommen die Chlorisotope 35Cl und 37Cl im Verhältnis 3:1 vor. Das Massenspektrum von CH3Cl (s. Abbildung) weist demnach ein Molekül-Ion mit der Masse 49,9 u (12C1H335Cl) und ein Molekül-Ion der Masse 51,9 u (12C1H337Cl) auf, die relative Intensität der Molekül-Ionen beträgt 3:1.