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01.12.2018 | Research article | Ausgabe 1/2018 Open Access

The Journal of Headache and Pain 1/2018

Genetic association of HCRTR2, ADH4 and CLOCK genes with cluster headache: a Chinese population-based case-control study

Zeitschrift:
The Journal of Headache and Pain > Ausgabe 1/2018
Autoren:
Zhiliang Fan, Lei Hou, Dongjun Wan, Ran Ao, Dengfa Zhao, Shengyuan Yu
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (https://​doi.​org/​10.​1186/​s10194-017-0831-1) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Abstract

Background

Cluster headache (CH), a rare primary headache disorder, is currently thought to be a genetic susceptibility which play a role in CH susceptibility. A large numbers of genetic association studies have confirmed that the HCRTR2 (Hypocretin Receptor 2) SNP rs2653349, and the ADH4 (Alcohol Dehydrogenase 4) SNP rs1126671 and rs1800759 polymorphisms are linked to CH. In addition, the CLOCK (Circadian Locomotor Output Cycles Kaput) gene is becoming a research hotspot for CH due to encoding a transcription factor that serves as a basic driving force for circadian rhythm in humans. The purpose of this study was to evaluate the association between CH and the HCRTR2, ADH4 and CLOCK genes in a Chinese CH case–control sample.

Methods

We genotyped polymorphisms of nine single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the HCRTR2, ADH4 and CLOCK genes to perform an association study on a Chinese Han CH case-control sample (112 patients and 192 controls),using Sequenom MALDI-TOF mass spectrometry iPLEX platform. The frequencies and distributions of genotypes and haplotypes were statistically compared between the case and control groups to identify associations with CH. The effects of SNPs on CH were further investigated by multiple logistic regression.

Results

The frequency of the HCRTR2 SNP rs3800539 GA genotype was significantly higher in cases than in controls (48.2% vs.37.0%). The GA genotypes was associated with a higher CH risk (OR = 1.483, 95% CI: 0.564-3.387, p = 0.038), however, after Bonferroni correction, the association lost statistical significance. Haplotype analysis of the HCRTR2 SNPs showed that among eight haplotypes, only H1-GTGGGG was linked to a reduced CH risk (44.7% vs. 53.1%, OR = 0.689, 95% CI =0.491~0.966, p = 0.030). No significant association of ADH4, CLOCK SNPs with CH was statistically detected in the present study.

Conclusions

Association between HCRTR2, ADH4,CLOCK gene polymorphisms and CH was not significant in the present study, however, haplotype analysis indicated H1-GTGGGG was linked to a reduced CH risk.
Zusatzmaterial
Additional file 1: Table S1. The sequences of the primers in this study. (DOCX 12 kb)
10194_2017_831_MOESM1_ESM.docx
Literatur
Über diesen Artikel

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