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12.05.2017 | Brief Report | Ausgabe 9/2017

Archives of Virology 9/2017

Genome characterization of a novel megrivirus-related avian picornavirus from a carnivorous wild bird, western marsh harrier (Circus aeruginosus)

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 9/2017
Autoren:
Ákos Boros, Péter Pankovics, Róbert Mátics, Ádám Adonyi, Nóra Bolba, Tung Gia Phan, Eric Delwart, Gábor Reuter
Wichtige Hinweise
The GenBank[/EMBL/DDBJ] accession number for the study sequence is: KY488458.

Abstract

In this study, the complete genome of a novel picornavirus called harrier picornavirus 1 (HaPV-1) strain harrier/MR-01/HUN/2014 (KY488458) was sequenced and analysed from a cloacal sample of a threatened, carnivorous wild bird, western marsh harrier (Circus aeruginosus). HaPV-1 was detectable from 2 of the 3 samples from harriers. HaPV-1 is phylogenetically related to megriviruses (genus Megrivirus) from domestic chicken, turkey and duck, showing a similar genome organization pattern; it also has an avian picornavirus-like “Unit A” motif in the 3’ UTR. Unlike the type-IV internal ribosomal entry site (IRES) of megriviruses, HaPV-1 is predicted to contain a type–II–like IRES, suggesting modular exchange of IRES elements between picornavirus genomes.

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