Skip to main content
main-content

28.05.2018 | Original Article | Ausgabe 10/2018 Open Access

Archives of Virology 10/2018

High frequency of Polio-like Enterovirus C strains with differential clustering of CVA-13 and EV-C99 subgenotypes in a cohort of Malawian children

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 10/2018
Autoren:
Lieke Brouwer, Sabine M. G. van der Sanden, Job C. J. Calis, Andrea H. L. Bruning, Steven Wang, Joanne G. Wildenbeest, Sjoerd P. H. Rebers, Kamija S. Phiri, Brenda M. Westerhuis, Michaël Boele van Hensbroek, Dasja Pajkrt, Katja C. Wolthers
Wichtige Hinweise
Handling Editor: Tim Skern.
Dasja Pajkrt and Katja C. Wolthers contributed equally to this work.

Abstract

Enteroviruses (EVs) are among the most commonly detected viruses infecting humans worldwide. Although the prevalence of EVs is widely studied, the status of EV prevalence in sub-Saharan Africa remains largely unknown. The objective of our present study was therefore to increase our knowledge on EV circulation in sub-Saharan Africa. We obtained 749 fecal samples from a cross-sectional study conducted on Malawian children aged 6 to 60 months. We tested the samples for the presence of EVs using real time PCR, and typed the positive samples based on partial viral protein 1 (VP1) sequences. A large proportion of the samples was EV positive (89.9%). 12.9% of the typed samples belonged to EV species A (EV-A), 48.6% to species B (EV-B) and 38.5% to species C (EV-C). More than half of the EV-C strains (53%) belonged to subgroup C containing, among others, Poliovirus (PV) 1-3. The serotype most frequently isolated in our study was CVA-13, followed by EV-C99. The strains of CVA-13 showed a vast genetic diversity, possibly representing a new cluster, ‘F’. The majority of the EV-C99 strains grouped together as cluster B. In conclusion, this study showed a vast circulation of EVs among Malawian children, with an EV prevalence of 89.9%. Identification of prevalences for species EV-C comparable to our study (38.5%) have only previously been reported in sub-Saharan Africa, and EV-C is rarely found outside of this region. The data found in this study are an important contribution to our current knowledge of EV epidemiology within sub-Saharan Africa.

Unsere Produktempfehlungen

e.Med Interdisziplinär

Kombi-Abonnement

Mit e.Med Interdisziplinär erhalten Sie Zugang zu allen CME-Fortbildungen und Fachzeitschriften auf SpringerMedizin.de. Zusätzlich können Sie eine Zeitschrift Ihrer Wahl in gedruckter Form beziehen – ohne Aufpreis.

e.Med Innere Medizin

Kombi-Abonnement

Mit e.Med Innere Medizin erhalten Sie Zugang zu CME-Fortbildungen des Fachgebietes Innere Medizin, den Premium-Inhalten der internistischen Fachzeitschriften, inklusive einer gedruckten internistischen Zeitschrift Ihrer Wahl.

e.Med Allgemeinmedizin

Kombi-Abonnement

Mit e.Med Allgemeinmedizin erhalten Sie Zugang zu allen CME-Fortbildungen und Premium-Inhalten der allgemeinmedizinischen Zeitschriften, inklusive einer gedruckten Allgemeinmedizin-Zeitschrift Ihrer Wahl.

Literatur
Über diesen Artikel

Weitere Artikel der Ausgabe 10/2018

Archives of Virology 10/2018 Zur Ausgabe

Neu im Fachgebiet Innere Medizin

Meistgelesene Bücher aus der Inneren Medizin

2017 | Buch

Rheumatologie aus der Praxis

Entzündliche Gelenkerkrankungen – mit Fallbeispielen

Dieses Fachbuch macht mit den wichtigsten chronisch entzündlichen Gelenk- und Wirbelsäulenerkrankungen vertraut. Anhand von über 40 instruktiven Fallbeispielen werden anschaulich diagnostisches Vorgehen, therapeutisches Ansprechen und der Verlauf …

Herausgeber:
Rudolf Puchner

2016 | Buch

Ambulant erworbene Pneumonie

Was, wann, warum – Dieses Buch bietet differenzierte Diagnostik und Therapie der ambulant erworbenen Pneumonie zur sofortigen sicheren Anwendung. Entsprechend der neuesten Studien und Leitlinien aller wichtigen Fachgesellschaften.

Herausgeber:
Santiago Ewig

Mail Icon II Newsletter

Bestellen Sie unseren kostenlosen Newsletter Update Innere Medizin und bleiben Sie gut informiert – ganz bequem per eMail.

© Springer Medizin 

Bildnachweise