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Erschienen in: Rechtsmedizin 6/2017

08.08.2017 | Originalien

Laborinterne vs. vorgegebene Grenzwerte für die DNA-Typisierung

verfasst von: PD Dr. K. Anslinger, B. Bayer, V. Brune, I. Schreier, J. Tschoche, D. von Máriássy

Erschienen in: Rechtsmedizin | Ausgabe 6/2017

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Zusammenfassung

Hintergrund

Zur Bestimmung von Menge und Qualität der aus einer unbekannten Spur extrahierten DNA und somit Optimierung der nachfolgenden Analyse wird heute routinemäßig eine quantitative PCR (qPCR) durchgeführt. Proben unzureichender DNA-Quantität oder Qualität können vorab aussortiert und verworfen werden. Die entsprechenden Grenzwerte werden in der Regel durch laborinterne Validierungen unter Berücksichtigung des gesamten Labor-Set-ups festgesetzt. Gleichwohl finden sich in Leistungsbeschreibungen zu öffentlichen Ausschreibungen immer wieder einheitlich, für alle Auftragnehmer verpflichtend, festgelegte Grenzwerte, die ggf. vom laborintern validierten Wert des Auftragnehmers abweichen.

Fragestellung

Zur Verifizierung der Frage ob, und wenn ja in welchem Ausmaß, eine solche Reglementierung dazu führen würde, dass potenziell typisierbare Proben verworfen werden, wurde eine Studie durchgeführt.

Material und Methodik

Im Rahmen dieser Studie wurden 2693 Proben, deren DNA-Gehalt über dem laborinternen (0,5 pg/µl, entspricht 5 pg Gesamtmenge DNA/PCR-Set-up), aber unter einem vorgebenden (5 pg/µl, entspricht 50 pg Gesamtmenge DNA/PCR Set-up) Grenzwert lag, einer STR-Typisierung zugeführt und die Ergebnisse ausgewertet.

Ergebnisse und Diskussion

Es konnte gezeigt werden, dass 36 % der Spuren (9 % zur Speicherung in der DNA-Datenbank geeignete Einzelmuster bzw. 27 % zum Direktvergleich mit Personen geeignete, reproduzierbare Mischungen) aus dem Bereich 0,5–5 pg/µl ein verwertbares Ergebnis erbrachten. Die Verwendung generalisierter Grenzwerte erscheint somit wenig sinnvoll.
Literatur
1.
Zurück zum Zitat Anslinger K, Bayer B, Rolf B, Keil W, Eisenmenger W (2005) Application of the biorobot EZ1 in a forensic laboratory. Leg Med 7:164–168CrossRef Anslinger K, Bayer B, Rolf B, Keil W, Eisenmenger W (2005) Application of the biorobot EZ1 in a forensic laboratory. Leg Med 7:164–168CrossRef
2.
Zurück zum Zitat Budowle B, Eisenberg AJ, van Daal A (2009) Validity of low copy number typing and applications to forensic science. Croat Med J 50(3):207–217CrossRefPubMedPubMedCentral Budowle B, Eisenberg AJ, van Daal A (2009) Validity of low copy number typing and applications to forensic science. Croat Med J 50(3):207–217CrossRefPubMedPubMedCentral
3.
Zurück zum Zitat Chung DT, Drábek J, Opel KL, Butler JM, McCord BR (2004) A study on the effects of degradation and template concentration on the amplification efficiency of the STR Miniplex primer sets. J Forensic Sci 49:733–740CrossRefPubMed Chung DT, Drábek J, Opel KL, Butler JM, McCord BR (2004) A study on the effects of degradation and template concentration on the amplification efficiency of the STR Miniplex primer sets. J Forensic Sci 49:733–740CrossRefPubMed
4.
Zurück zum Zitat Green RL, Roinestad IC, Boland C, Hennessy LK (2005) Developmental validation of the quantifiler real-time PCR kits for the quantification of human nuclear DNA samples. J Forensic Sci 50:809–825CrossRefPubMed Green RL, Roinestad IC, Boland C, Hennessy LK (2005) Developmental validation of the quantifiler real-time PCR kits for the quantification of human nuclear DNA samples. J Forensic Sci 50:809–825CrossRefPubMed
5.
Zurück zum Zitat Holt A, Wootton SC, Mulero JJ, Brzoska PM, Langit E, Green RL (2016) Developmental validation of the Quantifiler(®) HP and Trio Kits for human DNA quantification in forensic samples. Forensic Sci Int Genet 21:145–157CrossRefPubMed Holt A, Wootton SC, Mulero JJ, Brzoska PM, Langit E, Green RL (2016) Developmental validation of the Quantifiler(®) HP and Trio Kits for human DNA quantification in forensic samples. Forensic Sci Int Genet 21:145–157CrossRefPubMed
6.
Zurück zum Zitat Kremser A, Bayer B, Jung S, Anslinger K (2009) Quantifiler human DNA quantification kit (applied Biosystems) as a screening kit for DNA profiling. Forensic Science International: Genetics Supplement Series, FSIGSS354. Kremser A, Bayer B, Jung S, Anslinger K (2009) Quantifiler human DNA quantification kit (applied Biosystems) as a screening kit for DNA profiling. Forensic Science International: Genetics Supplement Series, FSIGSS354.
7.
Zurück zum Zitat LaSalle HE, Duncan G, McCord B (2011) An analysis of single and multi-copy methods for DNA quantitation by real-time polymerase chain reaction. Forensic Sci Int Genet 5:185–193CrossRefPubMed LaSalle HE, Duncan G, McCord B (2011) An analysis of single and multi-copy methods for DNA quantitation by real-time polymerase chain reaction. Forensic Sci Int Genet 5:185–193CrossRefPubMed
8.
Zurück zum Zitat Marshall PL, King JL, Budowle B (2015) Utility of amplification enhancers in low copy number DNA analysis. Int J Legal Med 129:43–52CrossRefPubMed Marshall PL, King JL, Budowle B (2015) Utility of amplification enhancers in low copy number DNA analysis. Int J Legal Med 129:43–52CrossRefPubMed
9.
Zurück zum Zitat McLaren RS, Bourdeau-Heller J, Patel J, Thompson JM, Pagram J, Loake T, Beesley D, Pirttimaa M, Hill CR, Duewer DL, Kline MC, Butler JM, Storts DR (2014) Developmental validation of the PowerPlex(®) ESI 16/17 Fast and PowerPlex(®) ESX 16/17 Fast Systems. Forensic Sci Int Genet 13:195–205CrossRefPubMed McLaren RS, Bourdeau-Heller J, Patel J, Thompson JM, Pagram J, Loake T, Beesley D, Pirttimaa M, Hill CR, Duewer DL, Kline MC, Butler JM, Storts DR (2014) Developmental validation of the PowerPlex(®) ESI 16/17 Fast and PowerPlex(®) ESX 16/17 Fast Systems. Forensic Sci Int Genet 13:195–205CrossRefPubMed
10.
Zurück zum Zitat McNevin D, Edson J, Robertson J, Austin JJ (2015) Reduced reaction volumes and increased Taq DNA polymerase concentration improve STR profiling outcomes from a real-world low template DNA source: telogen hairs. Forensic Sci Med Pathol 11:326–338CrossRefPubMed McNevin D, Edson J, Robertson J, Austin JJ (2015) Reduced reaction volumes and increased Taq DNA polymerase concentration improve STR profiling outcomes from a real-world low template DNA source: telogen hairs. Forensic Sci Med Pathol 11:326–338CrossRefPubMed
11.
Zurück zum Zitat Nielsen K, Mogensen HS, Hedman J, Niederstätter H, Parson W, Morling N (2008) Comparison of five DNA quantification methods. Forensic Sci Int Genet 2:226–230CrossRefPubMed Nielsen K, Mogensen HS, Hedman J, Niederstätter H, Parson W, Morling N (2008) Comparison of five DNA quantification methods. Forensic Sci Int Genet 2:226–230CrossRefPubMed
12.
Zurück zum Zitat Spezielle Regeln zur Umsetzung der DIN EN ISO/IEC 17025 für forensische DNA-Laboratorien 71 SD 3 010, Revision 1.3, 18.03.2016, Anhang 2 Spezielle Regeln zur Umsetzung der DIN EN ISO/IEC 17025 für forensische DNA-Laboratorien 71 SD 3 010, Revision 1.3, 18.03.2016, Anhang 2
13.
Zurück zum Zitat Ulbrich W, Anslinger K, Bäßler G, Eckert M, Fimmers R, Hohoff C, Kraft M, Leuker C, Molsberger G, Pich U, Razbin S, Schneider H, Templin M, Wächter A, Weirich V, Zierdt H, Schneider PM (2016) Gemeinsame Empfehlungen der Projektgruppe „Biostatistische DNA-Berechnungen“ und der Spurenkommission zur biostatistischen Bewertung von DNA-analytischen Befunden. Rechtsmedizin 26:291–298CrossRef Ulbrich W, Anslinger K, Bäßler G, Eckert M, Fimmers R, Hohoff C, Kraft M, Leuker C, Molsberger G, Pich U, Razbin S, Schneider H, Templin M, Wächter A, Weirich V, Zierdt H, Schneider PM (2016) Gemeinsame Empfehlungen der Projektgruppe „Biostatistische DNA-Berechnungen“ und der Spurenkommission zur biostatistischen Bewertung von DNA-analytischen Befunden. Rechtsmedizin 26:291–298CrossRef
14.
Zurück zum Zitat Van Nieuwerburgh F, Van Hoofstat D, Van Neste C, Deforce D (2014) Retrospective study of the impact of miniSTRs on forensic DNA profiling of touch DNA samples. Sci Justice 54:369–372CrossRefPubMed Van Nieuwerburgh F, Van Hoofstat D, Van Neste C, Deforce D (2014) Retrospective study of the impact of miniSTRs on forensic DNA profiling of touch DNA samples. Sci Justice 54:369–372CrossRefPubMed
15.
Zurück zum Zitat Vernarecci S, Ottaviani E, Agostino A, Mei E, Calandro L, Montagna P (2015) Quantifiler® Trio Kit and forensic samples management: a matter of degradation. Forensic Sci Int Genet 16:77–85CrossRefPubMed Vernarecci S, Ottaviani E, Agostino A, Mei E, Calandro L, Montagna P (2015) Quantifiler® Trio Kit and forensic samples management: a matter of degradation. Forensic Sci Int Genet 16:77–85CrossRefPubMed
16.
Zurück zum Zitat Weiler NE, Matai AS, Sijen T (2012) Extended PCR conditions to reduce drop-out frequencies in low template STR typing including unequal mixtures. Forensic Sci Int Genet 6:102–107CrossRefPubMed Weiler NE, Matai AS, Sijen T (2012) Extended PCR conditions to reduce drop-out frequencies in low template STR typing including unequal mixtures. Forensic Sci Int Genet 6:102–107CrossRefPubMed
Metadaten
Titel
Laborinterne vs. vorgegebene Grenzwerte für die DNA-Typisierung
verfasst von
PD Dr. K. Anslinger
B. Bayer
V. Brune
I. Schreier
J. Tschoche
D. von Máriássy
Publikationsdatum
08.08.2017
Verlag
Springer Medizin
Erschienen in
Rechtsmedizin / Ausgabe 6/2017
Print ISSN: 0937-9819
Elektronische ISSN: 1434-5196
DOI
https://doi.org/10.1007/s00194-017-0189-3

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