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05.12.2016 | Annotated Sequence Record | Ausgabe 4/2017

Archives of Virology 4/2017

Molecular characterization of a new soybean-infecting member of the genus Nepovirus identified by high-throughput sequencing

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 4/2017
Autoren:
Tuba Yasmin, Berlin D. Nelson, Houston A. Hobbs, Nancy K. McCoppin, Kris N. Lambert, Leslie L. Domier

Abstract

The complete nucleotide sequence of a new soybean-infecting member of the genus Nepovirus (provisionally named “soybean latent spherical virus” [SLSV]) was identified by high-throughput sequencing of RNAs from soybean leaf samples from North Dakota, USA. The sequences of RNAs 1 (8,190 nt) and 2 (5,788 nt) were completed by rapid amplification of cDNA ends. Each contained a single long open reading frame and a 3’ nontranslated region of greater than 1,500 nt. The predicted amino acid sequences of the two ORFs were most closely related to nepoviruses in subgroup C. Full-length cDNAs of RNAs 1 and 2 were cloned and used to inoculate soybean plants, which did not display obvious symptoms. These results suggest that SLSV represents a new species in the genus Nepovirus.

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