Skip to main content
main-content

20.11.2017 | Brief Report | Ausgabe 3/2018

Archives of Virology 3/2018

Nanovirus-alphasatellite complex identified in Vicia cracca in the Rhône delta region of France

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 3/2018
Autoren:
Romain Gallet, Simona Kraberger, Denis Filloux, Serge Galzi, Hugo Fontes, Darren P. Martin, Arvind Varsani, Philippe Roumagnac
Wichtige Hinweise
Handling Editor: F. Murilo Zerbini.

Electronic supplementary material

The online version of this article (https://​doi.​org/​10.​1007/​s00705-017-3634-4) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Abstract

Nanoviruses are multi-component plant-infecting single-stranded DNA viruses. Using a viral metagenomics-informed approach, a new nanovirus and two associated alphasatellite molecules have been identified in an uncultivated asymptomatic Vicia cracca plant in the Rhône region of France. This novel nanovirus genome includes eight genomic components (named DNA-R, DNA-S, DNA-M, DNA-C, DNA-N, DNA-U1, DNA-U2 and DNA-U4) and, across all components, shares < 66% pairwise sequence identity with other nanovirus genomes. The two associated alphasatellites share 62% identity with each other and < 81% identity will all other nanovirus-associated alphasatellites.

Bitte loggen Sie sich ein, um Zugang zu diesem Inhalt zu erhalten

★ PREMIUM-INHALT
e.Med Interdisziplinär

Mit e.Med Interdisziplinär erhalten Sie Zugang zu allen CME-Fortbildungen und Fachzeitschriften auf SpringerMedizin.de. Zusätzlich können Sie eine Zeitschrift Ihrer Wahl in gedruckter Form beziehen – ohne Aufpreis.

Bis zum 22.10. bestellen und 100 € sparen!

Weitere Produktempfehlungen anzeigen
Zusatzmaterial
Supplementary Figure 1 Alignment of the CR-I (A) and CR-II (B) regions identified in the CvLV sequences. The iterated triplet sequences and the presumed virion strand-origin of replication nonanucleotide sequence and a highly conserved motif in CR-II are highlighted in grey boxes. (PDF 227 kb)
705_2017_3634_MOESM1_ESM.pdf
Supplementary Table 1 Details of primer pairs used to recover the DNA-R, DNA-S, DNA-C, DNA-M, DNA-N, DNA-U1, DNA-U2 and DNA-U4 molecules and the alphasatellite molecules from cow vetch. (DOCX 14 kb)
705_2017_3634_MOESM2_ESM.docx
Supplementary Data 1 Pairwise identity matrix of nanovirus DNA-R, DNA-S, DNA-C, DNA-M, DNA-N, DNA-U1, DNA-U2, and DNA-U4 components and nanovirus-associated alphasatellite molecules (XLSX 107 kb)
705_2017_3634_MOESM3_ESM.xlsx
Literatur
Über diesen Artikel

Weitere Artikel der Ausgabe 3/2018

Archives of Virology 3/2018Zur Ausgabe

Virology Division News

Rymovirus: a cautionary tale

  1. Das kostenlose Testabonnement läuft nach 14 Tagen automatisch und formlos aus. Dieses Abonnement kann nur einmal getestet werden.

  2. Das kostenlose Testabonnement läuft nach 14 Tagen automatisch und formlos aus. Dieses Abonnement kann nur einmal getestet werden.

Neu im Fachgebiet Innere Medizin

 

 

 
 

Meistgelesene Bücher aus der Inneren Medizin

2017 | Buch

Rheumatologie aus der Praxis

Entzündliche Gelenkerkrankungen – mit Fallbeispielen

Dieses Fachbuch macht mit den wichtigsten chronisch entzündlichen Gelenk- und Wirbelsäulenerkrankungen vertraut. Anhand von über 40 instruktiven Fallbeispielen werden anschaulich diagnostisches Vorgehen, therapeutisches Ansprechen und der Verlauf …

Herausgeber:
Rudolf Puchner

2016 | Buch

Ambulant erworbene Pneumonie

Was, wann, warum – Dieses Buch bietet differenzierte Diagnostik und Therapie der ambulant erworbenen Pneumonie zur sofortigen sicheren Anwendung. Entsprechend der neuesten Studien und Leitlinien aller wichtigen Fachgesellschaften.

Herausgeber:
Santiago Ewig

Mail Icon II Newsletter

Bestellen Sie unseren kostenlosen Newsletter Update Innere Medizin und bleiben Sie gut informiert – ganz bequem per eMail.

© Springer Medizin 

Bildnachweise