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30.06.2018 | Original Article | Ausgabe 10/2018

Archives of Virology 10/2018

Prevalence of naturally occurring amino acid substitutions associated with resistance to hepatitis C virus NS3/NS4A protease inhibitors in São Paulo state

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 10/2018
Autoren:
Regina Célia Moreira, Ana Paula de Torres Santos, Gaspar Lisboa-Neto, Maria Cássia Jacintho Mendes-Corrêa, Marcilio Figueiredo Lemos, Fernanda Mello Malta, Rúbia Anita Ferraz Santana, Gregório Tadeu Fernando Dastoli, Vanessa Fusco Duarte de Castro, João Renato Rebello Pinho
Wichtige Hinweise
Communicated by Michael Carpenter.

Abstract

Hepatitis C (HCV)-infected patients are treated with direct-acting antiviral agents (DAAs) in highly effective, well-tolerated, all-oral regimens. However, naturally occurring resistance-associated amino acid substitutions (RASs) may be selected during treatment. This study aimed to screen naturally occurring RASs NS3/NS4A inhibitors (PIs). Samples were obtained from DAA naïve patients, living in São Paulo state, Brazil. Screening for RASs in the HCV NS3 region was conducted in 859 samples from HCV-infected patients, of which 425 and 434 samples were subtype 1a and 1b, respectively. HCV-RNA was extracted, amplified, and sequenced. The overall prevalence of RASs to HCV PIs was 9.4%. The following RASs were observed in HCV-1a subtype infected patients: V36L (2.6%), T54S (1.6%), V55I/A (1.2% / 8.9%, respectively), Q80K (2.1%), R155K (0.5%), and D168E (0.2%); and in HCV-1b infected patients: V36L (0.7%), T54A/S (0.2% and 0.5%, respectively), V55A (0.5%), Q80K (0.2%), D168E (1.6%), and M175L (0.5%). HCV 1a infected subjects had higher serum viral load than that seen in patients infected with HCV 1b. There was no difference between the proportions of NS3 RASs with regards to geographic distribution within the investigated areas. These findings should be supported by additional studies in Brazil to help in the formation of local clinical guidelines for managing hepatitis C.

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