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01.09.2009 | Article | Ausgabe 9/2009

European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 9/2009

Reliability of Pseudomonas aeruginosa semi-automated rep-PCR genotyping in various epidemiological situations

Zeitschrift:
European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases > Ausgabe 9/2009
Autoren:
A. Doléans-Jordheim, B. Cournoyer, E. Bergeron, J. Croizé, H. Salord, J. André, M.-A. Mazoyer, F. N. R. Renaud, J. Freney
Wichtige Hinweise
A. Doléans-Jordheim and B. Cournoyer contributed equally to this work.

Abstract

The purpose of this study was to evaluate the possibility of using a semi-automated repetitive DNA sequences-based polymerase chain reaction (rep-PCR) for typing Pseudomonas aeruginosa isolates. rep-PCR profiles obtained by the DiversiLab® system of 84 P. aeruginosa isolates from distinct epidemiological situations were obtained. rep-PCR groupings were in good agreement with the origin of these isolates. Linked rep-PCR profiles were observed for isolates recovered from a same family of cystic fibrosis (CF) patients, for the etiological agents of clustered cases of nosocomial infections, and for some isolates recovered from a same hospital room. rep-PCR and pulsed-field gel electrophoresis SpeI restricted genomic DNA (PFGE-SpeI) profiles were compared. In a few instances, rep-PCR revealed genetic divergences among isolates of a same group of PFGE-SpeI profiles. These divergences could reflect genetic drifts among closely related isolates, as illustrated by those observed between clinical and environmental isolates of a same group of PFGE-SpeI profiles. The interpretation of such differences will require further studies, but the rep-PCR analysis of P. aeruginosa diversity appeared to be an appropriate method to investigate infra-specific genetic relatedness.

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