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01.02.2013 | Brief Report | Ausgabe 2/2013

Archives of Virology 2/2013

Rubus canadensis virus 1, a novel betaflexivirus identified in blackberry

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 2/2013
Autoren:
Nina Abou Ghanem-Sabanadzovic, Ioannis E. Tzanetakis, Sead Sabanadzovic
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.​1007/​s00705-012-1484-7) contains supplementary material, which is available to authorized users.
The nucleotide sequence presented in this paper has been deposited in the GenBank database under accession number JX277553.

Abstract

Flexuous filaments, resembling flexivirus virions, were observed in partially purified blackberry preparations showing mild virus-like symptoms. Further tests revealed the presence of a novel betaflexivirus that is phylogenetically related to foveaviruses. The putative virus-encoded proteins shared limited similarity with orthologs of known members of the genus, indicating that the virus, provisionally named Rubus canadensis virus 1 (RuCV-1), represents a novel member of the taxon. Results of a survey in several U.S. states suggest that RuCV-1 is not widespread in the blackberry germplasm.

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