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Erschienen in:

11.07.2024 | Research

Simplifying synthesis of the expanding glioblastoma literature: a topic modeling approach

verfasst von: Mert Karabacak, Pemla Jagtiani, Alejandro Carrasquilla, Ankita Jain, Isabelle M. Germano, Konstantinos Margetis

Erschienen in: Journal of Neuro-Oncology | Ausgabe 3/2024

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Abstract

Purpose

Our study aims to discover the leading topics within glioblastoma (GB) research, and to examine if these topics have “hot” or “cold” trends. Additionally, we aim to showcase the potential of natural language processing (NLP) in facilitating research syntheses, offering an efficient strategy to dissect the landscape of academic literature in the realm of GB research.

Methods

The Scopus database was queried using “glioblastoma” as the search term, in the “TITLE” and “KEY” fields. BERTopic, an NLP-based topic modeling (TM) method, was used for probabilistic TM. We specified a minimum topic size of 300 documents and 5% probability cutoff for outlier detection. We labeled topics based on keywords and representative documents and visualized them with word clouds. Linear regression models were utilized to identify “hot” and “cold” topic trends per decade.

Results

Our TM analysis categorized 43,329 articles into 15 distinct topics. The most common topics were Genomics, Survival, Drug Delivery, and Imaging, while the least common topics were Surgical Resection, MGMT Methylation, and Exosomes. The hottest topics over the 2020s were Viruses and Oncolytic Therapy, Anticancer Compounds, and Exosomes, while the cold topics were Surgical Resection, Angiogenesis, and Tumor Metabolism.

Conclusion

Our NLP methodology provided an extensive analysis of GB literature, revealing valuable insights about historical and contemporary patterns difficult to discern with traditional techniques. The outcomes offer guidance for research directions, policy, and identifying emerging trends. Our approach could be applied across research disciplines to summarize and examine scholarly literature, guiding future exploration.
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Literatur
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50.
Metadaten
Titel
Simplifying synthesis of the expanding glioblastoma literature: a topic modeling approach
verfasst von
Mert Karabacak
Pemla Jagtiani
Alejandro Carrasquilla
Ankita Jain
Isabelle M. Germano
Konstantinos Margetis
Publikationsdatum
11.07.2024
Verlag
Springer US
Erschienen in
Journal of Neuro-Oncology / Ausgabe 3/2024
Print ISSN: 0167-594X
Elektronische ISSN: 1573-7373
DOI
https://doi.org/10.1007/s11060-024-04762-8

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