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05.05.2016 | Annotated Sequence Record | Ausgabe 7/2016

Archives of Virology 7/2016

The complete genomic sequence of a tentative new polerovirus identified in barley in South Korea

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 7/2016
Autoren:
Fumei Zhao, Seungmo Lim, Ran Hee Yoo, Davaajargal Igori, Sang-Min Kim, Do Yeon Kwak, Sun Lim Kim, Bong Choon Lee, Jae Sun Moon
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.​1007/​s00705-016-2881-0) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Abstract

The complete nucleotide sequence of a new barley polerovirus, tentatively named barley virus G (BVG), which was isolated in Gimje, South Korea, has been determined using an RNA sequencing technique combined with polymerase chain reaction methods. The viral genomic RNA of BVG is 5,620 nucleotides long and contains six typical open reading frames commonly observed in other poleroviruses. Sequence comparisons revealed that BVG is most closely related to maize yellow dwarf virus-RMV, with the highest amino acid identities being less than 90 % for all of the corresponding proteins. These results suggested that BVG is a member of a new species in the genus Polerovirus.

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