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05.08.2019 | Fungal Genomics and Pathogenesis (S Shoham, Section Editor) | Ausgabe 3/2019 Open Access

Current Fungal Infection Reports 3/2019

The Human Lung Mycobiome in Chronic Respiratory Disease: Limitations of Methods and Our Current Understanding

Zeitschrift:
Current Fungal Infection Reports > Ausgabe 3/2019
Autoren:
Danielle Weaver, Sara Gago, Michael Bromley, Paul Bowyer
Wichtige Hinweise
This article is part of the Topical Collection on Fungal Genomics and Pathogenesis

Publisher’s Note

Springer Nature remains neutral with regard to jurisdictional claims in published maps and institutional affiliations.

Abstract

Purpose of the Review

This review summarises the characteristics of the lung mycobiome in patients with chronic respiratory diseases and fungal lung diseases. We have also reviewed the limitations of the current methods in mycobiome studies.

Recent Findings

Available studies in the impacts of the mycobiome in chronic and fungal lung diseases are scarce and comparison of the available studies is hindered by heterogeneity in the sample sizes, methods and patient selection.

Summary

The impact of the diversity and composition of the lung mycobiome in chronic and fungal lung diseases is poorly understood. Most studies involve detection of fungi in respiratory samples by culture. However, such methods lack sensitivity and the emergence of next-generation sequencing technologies is an important advance. However, differences in the sequencing methodologies limit study comparisons. Well-designed methodological approaches and large cohort studies are needed to evaluate the impact of the lung mycobiome in respiratory diseases.

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Literatur
Über diesen Artikel

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