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01.08.2014 | Original Paper | Ausgabe 4/2014

Cellular Oncology 4/2014

Validation of DNA promoter hypermethylation biomarkers in breast cancer — a short report

Zeitschrift:
Cellular Oncology > Ausgabe 4/2014
Autoren:
Jolien S. de Groot, Xiaojuan Pan, Jan Meeldijk, Elsken van der Wall, Paul J. van Diest, Cathy B. Moelans
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.​1007/​s13402-014-0189-1) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Abstract

Purpose

DNA promoter hypermethylation of tumor suppressor genes is known to occur early in cancer development, including breast cancer. To improve early breast cancer detection, we aimed to investigate whether the identification of DNA promoter hypermethylation might be of added value.

Methods

The methylation status of a panel of 19 candidate genes (AKR1B1, ALX1, ARHGEF7, FZD10, GHSR, GPX7, GREM1, GSTP1, HOXD1, KL, LHX2, MAL, MGMT, NDRG2, RASGRF2, SFRP1, SFRP2, TM6SF1 and TMEFF2) was determined in formalin-fixed paraffin-embedded normal breast and breast cancer tissue samples using gel-based methylation-specific PCR (MSP).

Results

The promoters of the AKR1B1, ALX1, GHSR, GREM1, RASGRF2, SFRP2, TM6SF1 and TMEFF2 genes were found to be significantly differentially methylated in normal versus malignant breast tissues. Based on sensitivity, specificity and logistic regression analyses the best performing genes for detecting breast cancer were identified. Through multivariate analyses, we found that AKR1B1 and TM6SF1 could detect breast cancer with an area under the curve (AUC) of 0.986 in a receiver operating characteristic (ROC) assessment.

Conclusions

Based on our data, we conclude that AKR1B1 and TM6SF1 may serve as candidate methylation biomarkers for early breast cancer detection. Further studies are underway to evaluate the methylation status of these genes in body fluids, including nipple aspirates and blood.

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