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Archives of Virology

Erschienen in:

19.10.2022 | Annotated Sequence Record

Molecular characterization of a novel mitovirus from Rhizoctonia solani AG-4 HGIII strain XMC-IF

verfasst von: Aili Sun, Yang Sun, Li Luo, Lianjing Zhao, Chengyun Li, Genhua Yang, Wenhan Dong

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 12/2022

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Abstract

The nucleotide sequence of a viral double-stranded RNA (dsRNA) from Rhizoctonia solani AG-4 HGIII strain XMC-IF (designated as "Rhizoctonia solani mitovirus 106", RsMV-106) was determined. The complete sequence was 2794 bp in length with a 57.50% A + U content and contained a large open reading frame (ORF) when the fungal mitochondrial genetic code was used. The ORF potentially encodes a 95.76-kDa protein containing a conserved domain of an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). BLASTp analysis revealed that the RdRp domain of RsMV-106 shared 47.52–73.24% sequence identity with those of viruses of the genus Duamitovirus and was most similar (73.24% identity) to that of Alternaria alternata mitovirus 1 (AaMV1). Phylogenetic analysis showed that RsMV-106 is a novel member of the genus Duamitovirus, family Mitoviridae. This is the first report of the full genome sequence of a mitovirus associated with R. solani AG-4 HGIII.

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Titel: Molecular characterization of a novel mitovirus from Rhizoctonia solani AG-4 HGIII strain XMC-IF
verfasst von: Aili Sun
Yang Sun
Li Luo
Lianjing Zhao
Chengyun Li
Genhua Yang
Wenhan Dong
Publikationsdatum: 19.10.2022
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 12/2022
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-022-05599-0

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