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Erschienen in: neurogenetics 4/2009

01.10.2009 | SHORT COMMUNICATION

Alu-specific microhomology-mediated deletions in CDKL5 in females with early-onset seizure disorder

verfasst von: Ayelet Erez, Amina J. Patel, Xueqing Wang, Zhilian Xia, Samarth S. Bhatt, William Craigen, Sau Wai Cheung, Richard A. Lewis, Ping Fang, Sandra L. H. Davenport, Pawel Stankiewicz, Seema R. Lalani

Erschienen in: Neurogenetics | Ausgabe 4/2009

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Abstract

Mutations in the cyclin-dependent kinase-like 5 (CDKL5) gene in Xp22.13 have been associated with infantile spasms, early-onset intractable epilepsy, and a Rett syndrome (RTT)-like phenotype. Using array comparative genomic hybridization, we identified variable-sized microdeletions involving exons 1–4 of the CDKL5 gene in three females with early-onset seizures. Two of these deletions were flanked by Alu repetitive elements and may have resulted from either non-allelic homologous recombination or the microhomology-mediated Fork Stalling and Template Switching/Microhomology-Mediated Break-Induced Replication mechanism. Our findings demonstrate the first instance of genomic deletion as the molecular basis of CDKL5 deficiency in females and highlight the importance of exon targeted array-CGH analysis for this gene in females with drug-resistant early-onset seizures.
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Literatur
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Zurück zum Zitat Kalscheuer VM, Tao J, Donnelly A, Hollway G, Schwinger E, Kubart S, Menzel C, Hoeltzenbein M, Tommerup N, Eyre H, Harbord M, Haan E, Sutherland GR, Ropers HH, Gecz J (2003) Disruption of the serine/threonine kinase 9 gene causes severe X-linked infantile spasms and mental retardation. Am J Hum Genet 72:1401–1411. doi:10.1086/375538 CrossRefPubMed Kalscheuer VM, Tao J, Donnelly A, Hollway G, Schwinger E, Kubart S, Menzel C, Hoeltzenbein M, Tommerup N, Eyre H, Harbord M, Haan E, Sutherland GR, Ropers HH, Gecz J (2003) Disruption of the serine/threonine kinase 9 gene causes severe X-linked infantile spasms and mental retardation. Am J Hum Genet 72:1401–1411. doi:10.​1086/​375538 CrossRefPubMed
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Zurück zum Zitat Froyen G, Van Esch H, Bauters M, Hollanders K, Frints SG, Vermeesch JR, Devriendt K, Fryns JP, Marynen P (2007) Detection of genomic copy number changes in patients with idiopathic mental retardation by highresolution X-array-CGH: important role for increased gene dosage of XLMR genes. Hum Mutat 28(10):1034–42. doi:10.1002/humu.20564 Froyen G, Van Esch H, Bauters M, Hollanders K, Frints SG, Vermeesch JR, Devriendt K, Fryns JP, Marynen P (2007) Detection of genomic copy number changes in patients with idiopathic mental retardation by highresolution X-array-CGH: important role for increased gene dosage of XLMR genes. Hum Mutat 28(10):1034–42. doi:10.​1002/​humu.​20564
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Metadaten
Titel
Alu-specific microhomology-mediated deletions in CDKL5 in females with early-onset seizure disorder
verfasst von
Ayelet Erez
Amina J. Patel
Xueqing Wang
Zhilian Xia
Samarth S. Bhatt
William Craigen
Sau Wai Cheung
Richard A. Lewis
Ping Fang
Sandra L. H. Davenport
Pawel Stankiewicz
Seema R. Lalani
Publikationsdatum
01.10.2009
Verlag
Springer-Verlag
Erschienen in
Neurogenetics / Ausgabe 4/2009
Print ISSN: 1364-6745
Elektronische ISSN: 1364-6753
DOI
https://doi.org/10.1007/s10048-009-0195-z

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