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Erschienen in: Archives of Virology 7/2019

22.04.2019 | Annotated Sequence Record

Genome sequencing and characterization of three Bacillus cereus-specific phages, DK1, DK2, and DK3

verfasst von: Li Kong, Yu Ding, Qingping Wu, Juan Wang, Jumei Zhang, Hongye Li, Shubo Yu, Pengfei Yu, Tiantian Gao, Haiyan Zeng, Meiyan Yang, Yongjian Liang, Zhi Wang, Zhiqing Xie, Qianwen Wang

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 7/2019

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Abstract

In the study, three Bacillus cereus-specific phages, named DK1, DK2 and DK3, belonging to the family Podoviridae, were isolated from Pearl River water and sludge in Guangzhou, China. The genomes of DK1, DK2 and DK3 were 27,180 bp, 26,357 bp, and 26,865 bp in length and contained 49, 45 and 46 open reading frames, respectively. Among the three phages, DK2 shared the highest genome sequence similarity (96% identity) with DK3. Genes encoding rRNA, tRNA, virulence factors and antibiotic resistance were absent in these phage genomes. In addition, comparative genomic and phylogenetic analysis revealed that they were novel phages of B. cereus. Each genome encoded a putative endolysin that might be of value for the control of the foodborne pathogen B. cereus.
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Metadaten
Titel
Genome sequencing and characterization of three Bacillus cereus-specific phages, DK1, DK2, and DK3
verfasst von
Li Kong
Yu Ding
Qingping Wu
Juan Wang
Jumei Zhang
Hongye Li
Shubo Yu
Pengfei Yu
Tiantian Gao
Haiyan Zeng
Meiyan Yang
Yongjian Liang
Zhi Wang
Zhiqing Xie
Qianwen Wang
Publikationsdatum
22.04.2019
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 7/2019
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-019-04258-1

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