Background
Methods
Samples
Gender | Age | Ethnic group | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Disease | N | (%) | M | F | Average | Std. Dev. | White | Mulatto | Black |
Bone Marrow Aplasia | 1 | 0.03 | 0 | 1 | 30.0 | 0.00 | 1 | 0 | 0 |
Paroxysmal Nocturna Hemoglobinuria | 2 | 0.05 | 2 | 0 | 31.5 | 2.10 | 2 | 0 | 0 |
NK Leukemia Cells | 1 | 0.03 | 1 | 0 | 13.0 | 0.00 | 1 | 0 | 0 |
Non Hodgkin Lymphoma - Follicular | 1 | 0.03 | 0 | 1 | 39.0 | 0.00 | 1 | 0 | 0 |
Acute Lymphoid Leukemia | 13 | 0.33 | 7 | 6 | 15.2 | 16.70 | 11 | 2 | 0 |
Acute Myeloid Leukemia | 11 | 0.28 | 7 | 4 | 35.7 | 17.80 | 3 | 0 | 0 |
Chronic Myeloid Leukemia | 3 | 0.08 | 3 | 0 | 31.7 | 9.60 | 1 | 0 | 0 |
Myelodysplasia | 1 | 0.03 | 1 | 0 | 23.0 | 0.00 | 2 | 0 | 0 |
Myelofibrosis | 2 | 0.05 | 1 | 1 | 50.5 | 12.00 | 1 | 0 | 0 |
Multiple Myeloma | 1 | 0.03 | 1 | 0 | 40.0 | 0.00 | 1 | 1 | 0 |
MyelodysplasticMyeloproliferativeSyndrome | 2 | 0.05 | 1 | 1 | 42.0 | 1.40 | 10 | 1 | 0 |
Not Informed | 1 | 0.03 | 1 | 0 | NI | NI | 1 | 0 | 0 |
Total | 39 | 1 | 25 | 14 | 35 | 4 | 0 |
Extraction of genomic DNA
Typing of KIR genes
Statistical analysis
Results
KIR genes | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
2DL1 | 2DL2 | 2DL3 |
2DL4
| 2DL5 | 2DP1 | 2DS1 | 2DS2 | 2DS3 | 2DS4 | 2DS5 | 3DL1 |
3DL2
|
3DL3
|
3DP1
| 3DS1 | ||
Patients | absolutefrequency | 35 | 9 | 36 | 39 | 11 | 37 | 6 | 12 | 5 | 36 | 11 | 37 | 39 | 39 | 39 | 10 |
N = 39 | relativefrequency | 0,90 | 0,23 | 0,92 | 1,00 | 0,28 | 0,95 | 0,15 | 0,31 | 0,13 | 0,92 | 0,28 | 0,95 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,26 |
genefrequency | 0,68 | 0,12 | 0,72 | 1,00 | 0,15 | 0,77 | 0,08 | 0,17 | 0,07 | 0,72 | 0,15 | 0,77 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,14 | |
BoneMarrow Aplasia | absolutefrequency | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 |
N = 1 | relativefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 |
genefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | |
ParoxysmalNocturnaHemoglobinuria | absolutefrequency | 2 | 0 | 2 | 2 | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 | 2 | 0 | 2 | 2 | 2 | 2 | 0 |
N = 2 | relativefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,50 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 |
genefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,29 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | |
NK LeukemiaCells | absolutefrequency | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
N = 1 | relativefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 |
genefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | |
Non Hodgkin Lymphoma - Follicular | absolutefrequency | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
N = 1 | relativefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 |
genefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | |
AcuteLymphoidLeukemia | absolutefrequency | 12 | 3 | 12 | 13 | 4 | 13 | 2 | 3 | 2 | 12 | 5 | 13 | 13 | 13 | 13 | 2 |
N = 13 | relativefrequency | 0,92 | 0,23 | 0,92 | 1,00 | 0,31 | 1,00 | 0,15 | 0,23 | 0,15 | 0,92 | 0,38 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,15 |
genefrequency | 0,72 | 0,12 | 0,72 | 1,00 | 0,17 | 1,00 | 0,08 | 0,12 | 0,08 | 0,72 | 0,22 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,08 | |
AcuteMyeloidLeukemia | absolutefrequency | 8 | 3 | 9 | 11 | 4 | 9 | 2 | 5 | 2 | 9 | 3 | 10 | 11 | 11 | 11 | 5 |
N = 11 | relativefrequency | 0,73 | 0,27 | 0,82 | 1,00 | 0,36 | 0,82 | 0,18 | 0,45 | 0,18 | 0,82 | 0,27 | 0,91 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,45 |
genefrequency | 0,48 | 0,15 | 0,57 | 1,00 | 0,20 | 0,57 | 0,10 | 0,26 | 0,10 | 0,57 | 0,15 | 0,70 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,26 | |
ChronicMyeloidLeukemia | absolutefrequency | 3 | 0 | 3 | 3 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 3 | 1 | 3 | 3 | 3 | 3 | 0 |
N = 3 | relativefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,33 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 |
genefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,18 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | |
Myelodysplasia | absolutefrequency | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
N = 1 | relativefrequency | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 |
genefrequency | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | |
Myelofibrosis | absolutefrequency | 2 | 0 | 2 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 2 | 2 | 2 | 2 | 0 |
N = 2 | relativefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 |
genefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | |
MultipleMyeloma | absolutefrequency | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
N = 1 | relativefrequency | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 |
genefrequency | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | |
MyelodysplasticMyeloproliferativeSyndrome | absolutefrequency | 2 | 0 | 2 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 |
N = 2 | relativefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,50 |
genefrequency | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 0,00 | 0,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,29 | |
NotInformed | absolutefrequency | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0 |
N = 1 | relativefrequency | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 |
genefrequency | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 1,00 | 0,00 |
KIR gene | Patient | Control | p-value | |
---|---|---|---|---|
(n = 39) | (n = 136) | |||
Framework |
KIR2DL4
| 39 (100 %) | 136 (100 %) | 1.0000 |
KIR3DL2
| 39 (100 %) | 136 (100 %) | 1.0000 | |
KIR3DL3
| 39 (100 %) | 136 (100 %) | 1.0000 | |
KIR3DP1
| 39 (100 %) | 136 (100 %) | 1.0000 | |
Haplotype A |
KIR2DS4
| 36 (92 %) | 129 (95 %) | 0.6936 |
KIR2DL1
| 35 (90 %) | 130 (96 %) | 0.2329 | |
KIR2DL3
| 36 (92 %) | 118 (87 %) | 0.4173 | |
KIR3DL1
| 37 (95 %) | 129 (95 %) | 1.0000 | |
Haplotype B |
KIR2DS1
| 6 (15 %) | 59 (43 %) |
0.0013 (
a
)
|
KIR2DS2
| 12 (31 %) | 78 (57 %) |
0.0038 (
a
)
| |
KIR2DS3
| 5 (13 %) | 45 (33 %) |
0.0153 (
a
)
| |
KIR2DS5
| 11 (28 %) | 45 (33 %) | 0.6976 | |
KIR3DS1
| 10 (26 %) | 53 (39 %) | 0.1356 | |
KIR2DL2
| 9 (23 %) | 75 (55 %) |
0.0005 (
a
)
| |
KIR2DL5
| 11 (28 %) | 72 (53 %) |
0.0067 (
a
)
| |
Haplotype A/B |
KIR2DP1
| 37 (95 %) | 131 (96 %) | 0.6465 |
All | AML | p-value | ||
---|---|---|---|---|
KIR GENE | (n = 12) | (n = 11) | ||
Framework |
KIR2DL4
| 12 (100 %) | 11 (100 %) | 1.0000 |
KIR3DL2
| 12 (100 %) | 11 (100 %) | 1.0000 | |
KIR3DL3
| 12 (100 %) | 11 (100 %) | 1.0000 | |
KIR3DP1
| 12 (100 %) | 11 (100 %) | 1.0000 | |
Haplotype A |
KIR2DS4
| 11 (92 %) | 9 (82 %) | 0.5921 |
KIR2DL1
| 11 (92 %) | 8 (73 %) | 0.3168 | |
KIR2DL3
| 11 (92 %) | 9 (82 %) | 0.5901 | |
KIR3DL1
| 12 (100 %) | 10 (91 %) | 0.4783 | |
Haplotype B |
KIR2DS1
| 10 (83 %) | 9 (82 %) | 1.0000 |
KIR2DS2
| 3 (25 %) | 3 (27 %) | 1.0000 | |
KIR2DS3
| 2 (17 %) | 9 (82 %) |
0.0031 (
a
)
| |
KIR2DS5
| 5 (42 %) | 3 (27 %) | 0.6668 | |
KIR3DS1
| 2 (17 %) | 5 (45 %) | 0.1930 | |
KIR2DL2
| 3 (25 %) | 3 (27 %) | 1.0000 | |
KIR2DL5
| 4 (33 %) | 4 (36 %) | 1.0000 | |
Haplotype A/B |
KIR2DP1
| 12 (100 %) | 9 (82 %) | 0.2174 |