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Archives of Virology
Erschienen in: Archives of Virology 11/2015

01.11.2015 | Annotated Sequence Record

Complete genome analysis of equine coronavirus isolated in Japan

verfasst von: Manabu Nemoto, Yasuhiro Oue, Satoshi Murakami, Toru Kanno, Hiroshi Bannai, Koji Tsujimura, Takashi Yamanaka, Takashi Kondo

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 11/2015

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Abstract

Equine coronavirus has been responsible for several outbreaks of disease in the United States and Japan. Only one complete genome sequence (NC99 isolated in the US) had been reported for this pathogenic RNA virus. Here, we report the complete genome sequences of three equine coronaviruses isolated in 2009 and 2012 in Japan. The genome sequences of Tokachi09, Obihiro12-1 and Obihiro12-2 were 30,782, 30,916 and 30,916 nucleotides in length, respectively, excluding the 3’-poly (A) tails. All three isolates were genetically similar to NC99 (98.2–98.7 %), but deletions and insertions were observed in the genes nsp3 of ORF1a, NS2 and p4.7.
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Metadaten
Titel
Complete genome analysis of equine coronavirus isolated in Japan
verfasst von
Manabu Nemoto
Yasuhiro Oue
Satoshi Murakami
Toru Kanno
Hiroshi Bannai
Koji Tsujimura
Takashi Yamanaka
Takashi Kondo
Publikationsdatum
01.11.2015
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 11/2015
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-015-2565-1

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