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22.01.2019 | Annotated Sequence Record | Ausgabe 3/2019

Archives of Virology 3/2019

Complete genome sequence of an alternavirus from the phytopathogenic fungus Fusarium incarnatum

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 3/2019
Autoren:
Xiaoting Zhang, Yuan Xie, Fang Zhang, Hangjun Sun, Yingying Zhai, Songbai Zhang, Hongxia Yuan, Lin Zhou, Fei Gao, Honglian Li
Wichtige Hinweise
Handling Editor: Robert H. A. Coutts.

Electronic supplementary material

The online version of this article (https://​doi.​org/​10.​1007/​s00705-018-04128-2) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Data Deposition Information are available at http://​www.​ncbi.​nlm.​nih.​gov/​.

Abstract

A novel double-stranded RNA (dsRNA) mycovirus, named “Fusarium incarnatum alternavirus 1” (FiAV1), was found in Fusarium incarnatum strain LY003-07, the causal agent of peony root rot. The complete genome of FiAV1 is composed of three dsRNA segments, dsRNA1 (3548 nt), dsRNA2 (2514 nt), and dsRNA3 (2498 nt), with one open reading frame on each of their positive-sense strands. As found in other viruses of the proposed family Alternaviridae, the positive-sense strand of each genomic dsRNA of FiAV1 has a poly(A) tail and the 5’-terminal nonamer sequence 5’-GGCTGTGTG-3’. Based on a multiple sequence alignment and phylogenetic analysis based on the RdRps amino acid sequence, FiAV1 is suggested to be a new strain of a potential new species, for which the name “Fusarium alternavirus 1” is proposed, that includes Fusarium poae alternavirus 1 (FpAV1) and Fusarium graminearum alternavirus 1 (FgAV1/AH11) of the proposed family “Alternaviridae”. This is the first report of a mycovirus of the proposed family “Alternaviridae” that infects F. incarnatum.

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705_2018_4128_MOESM1_ESM.docx
Supplementary material 2 (PDF 480 kb) Supplemental Figure 2 Phylogenetic analysis of FiAV1 and selected members of the families Alternaviridae (▲, FiAV1 in red▲), Fusariviridae (⃞), Hypoviridae (⃝) and Totiviridae based on the aligned RdRp aa sequences of the viruses by the neighbor-joining method using the program MEGA 7.0. Bootstrap values (1000 replicates) are shown at the nodes. The scale bar (0.1) corresponds to genetic distance
705_2018_4128_MOESM2_ESM.pdf
Literatur
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