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Archives of Virology

Erschienen in:

01.04.2008 | Annotated Sequence Record

Complete nucleotide sequence of a South African isolate of grapevine leafroll-associated virus 3 reveals a 5′UTR of 737 nucleotides

verfasst von: H. J. Maree, M. -J. Freeborough, J. T. Burger

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 4/2008

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Excerpt

Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) is the type species of the genus Ampelovirus (family Closteroviridae) [1]. It is an economically important virus that is known to only infect Vitis spp. and that has a negative impact on the wine and table grape industries worldwide. To date, there has been only one report that claims the complete nucleotide sequence of GLRaV-3, by Ling et al. in 2004 (isolate NY-1, AF037268) [2]. In that report the 5′ untranslated region (UTR) was found to be 158 nt in length. Here we report that the sequence of GLRaV-3, isolate GP18¹, has a 5′UTR of 737 nt. This extended UTR was found in all other South African isolates of GLRaV-3 that were analysed. …

The GenBank accession number for the sequence reported in this paper is EU259806.

Martelli GP, Agranovsky AA, Bar-Joseph M, Boscia D, Candresse T, Coutts RHA, Dolja VV, Falk BW, Gonsalves D, Jelkmann W, Karasev AV, Minafra A, Namba S, Vetten HJ, Wisler GC, Yoshikawa N (2002) The family Closteroviridae revised. Arch Virol 147(10):2039–2044

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Titel: Complete nucleotide sequence of a South African isolate of grapevine leafroll-associated virus 3 reveals a 5′UTR of 737 nucleotides
verfasst von: H. J. Maree
M. -J. Freeborough
J. T. Burger
Publikationsdatum: 01.04.2008
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 4/2008
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-008-0040-y

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