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Archives of Virology

Erschienen in:

04.03.2017 | Annotated Sequence Record

Complete nucleotide sequences of M and L RNAs from a new pepper-infecting tospovirus, Pepper chlorotic spot virus

verfasst von: Kuo-Shiou Huang, Chia-Hsing Tai, Ying-Huey Cheng, Shu-Hui Lin, Tsung-Chi Chen, Fuh-Jyh Jan

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 7/2017

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Abstract

Pepper chlorotic spot virus (PCSV), newly found in Taiwan, was identified as a new tospovirus based on the molecular characterization of its S RNA. In this study, the complete M and L RNA sequences of PCSV were determined. The M RNA has 4795 nucleotides (nts), encoding the NSm protein of 311 aa (34.5 kDa) in the viral (v) strand and the glycoprotein precursor (Gn/Gc) of 1122 aa (127.6 kDa) in the viral complementary (vc) strand. The L RNA has 8859 nts, encoding the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) of 2873 aa (330.8 kDa) in the vc strand. Analyses of the NSm, Gn/Gc and RdRp of PCSV revealed that PCSV is phylogenetically clustered within the watermelon silver mottle virus-related clade. Based on the whole genome sequence, PCSV is closely related to Tomato necrotic ringspot virus and should be classified as a new tospovirus species.

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Titel: Complete nucleotide sequences of M and L RNAs from a new pepper-infecting tospovirus, Pepper chlorotic spot virus
verfasst von: Kuo-Shiou Huang
Chia-Hsing Tai
Ying-Huey Cheng
Shu-Hui Lin
Tsung-Chi Chen
Fuh-Jyh Jan
Publikationsdatum: 04.03.2017
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 7/2017
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-017-3260-1

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