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Erschienen in: Archives of Virology 8/2008

01.08.2008 | Original Article

False I50V resistance readings of HIV isolates: co-amplification of NASBA HIV-1 RNA QT internal calibrators and HIV-1 patient isolates may lead to a false I50V mutation resistance reading in genotypic tests

verfasst von: A. Waléria-Aleixo, D. B. Greco, R. Brindeiro, A. Tanuri

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 8/2008

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Abstract

The I50V protease inhibitor (PI) resistance mutation was found in 87.4% of protease gene fragments sequenced from 199 nucleic acid isolates extracted using an NASBA virus load assay, performed between 1997 and 2001 in Brazil. This mutation is an amprenavir-related mutation, and at that particular time this PI was seldom used in Brazil. This mutation was found both in patients with and without therapeutic success. Q calibrators showed the PI resistance mutation I50V when directly amplified and sequenced from the 423-bp PCR product targeting protease gene. The majority of the patients’ samples had a mixture of I50I and I50V; however, this artifact was nor seen when a 989-bp PCR product was used. These results show that RNA extracted using virus load kits need to be critically evaluated before being used in home-brew genotypic tests.
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Metadaten
Titel
False I50V resistance readings of HIV isolates: co-amplification of NASBA HIV-1 RNA QT internal calibrators and HIV-1 patient isolates may lead to a false I50V mutation resistance reading in genotypic tests
verfasst von
A. Waléria-Aleixo
D. B. Greco
R. Brindeiro
A. Tanuri
Publikationsdatum
01.08.2008
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 8/2008
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-008-0138-2

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