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Archives of Virology
Erschienen in: Archives of Virology 12/2014

01.12.2014 | Annotated Sequence Record

Genome sequence of vanilla distortion mosaic virus infecting Coriandrum sativum

verfasst von: I. P. Adams, S. Rai, M. Deka, V. Harju, T. Hodges, G. Hayward, A. Skelton, A. Fox, N. Boonham

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 12/2014

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Abstract

The 9573-nucleotide genome of a potyvirus was sequenced from a Coriandrum sativum plant from India with viral symptoms. On analysis, this virus was shown to have greater than 85 % nucleotide sequence identity to vanilla distortion mosaic virus (VDMV). Analysis of the putative coat protein sequence confirmed that this virus was in fact VDMV, with greater than 91 % amino acid sequence identity. The genome appears to encode a 3083-amino-acid polyprotein potentially cleaved into the 10 mature proteins expected in potyviruses. Phylogenetic analysis confirmed that VDMV is a distinct but ungrouped member of the genus Potyvirus.
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Metadaten
Titel
Genome sequence of vanilla distortion mosaic virus infecting Coriandrum sativum
verfasst von
I. P. Adams
S. Rai
M. Deka
V. Harju
T. Hodges
G. Hayward
A. Skelton
A. Fox
N. Boonham
Publikationsdatum
01.12.2014
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 12/2014
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-014-2215-z

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