Skip to main content
main-content

22.01.2019 | Original Article | Ausgabe 3/2019 Open Access

Archives of Virology 3/2019

High frequency and diversity of parechovirus A in a cohort of Malawian children

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 3/2019
Autoren:
Lieke Brouwer, Eveliina Karelehto, Alvin X. Han, Xiomara V. Thomas, Andrea H. L. Bruning, Job C. J. Calis, Michaël Boele van Hensbroek, Brenda M. Westerhuis, Darsha Amarthalingam, Sylvie M. Koekkoek, Sjoerd P. H. Rebers, Kamija S. Phiri, Katja C. Wolthers, Dasja Pajkrt
Wichtige Hinweise
Handling Editor: Zhenhai Chen.

Electronic supplementary material

The online version of this article (https://​doi.​org/​10.​1007/​s00705-018-04131-7) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Katja C. Wolthers and Dasja Pajkrt contributed equally to this work.

Publisher's Note

Springer Nature remains neutral with regard to jurisdictional claims in published maps and institutional affiliations.

Abstract

Parechoviruses (PeVs) are highly prevalent viruses worldwide. Over the last decades, several studies have been published on PeV epidemiology in Europe, Asia and North America, while information on other continents is lacking. The aim of this study was to describe PeV circulation in a cohort of children in Malawi, Africa. A total of 749 stool samples obtained from Malawian children aged 6 to 60 months were tested for the presence of PeV by real-time PCR. We performed typing by phylogenetic and Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) analysis. PeV was found in 57% of stool samples. Age was significantly associated with PeV positivity (p = 0.01). Typing by phylogenetic analysis resulted in 15 different types, while BLAST typing resulted in 14 different types and several indeterminate strains. In total, six strains showed inconsistencies in typing between the two methods. One strain, P02-4058, remained untypable by all methods, but appeared to belong to the recently reclassified PeV-A19 genotype. PeV-A1, -A2 and -A3 were the most prevalent types (26.8%, 13.8% and 9.8%, respectively). Both the prevalence and genetic diversity found in our study were remarkably high. Our data provide an important contribution to the scarce data available on PeV epidemiology in Africa.

Unsere Produktempfehlungen

e.Med Interdisziplinär

Kombi-Abonnement

Mit e.Med Interdisziplinär erhalten Sie Zugang zu allen CME-Fortbildungen und Fachzeitschriften auf SpringerMedizin.de. Zusätzlich können Sie eine Zeitschrift Ihrer Wahl in gedruckter Form beziehen – ohne Aufpreis.

e.Med Innere Medizin

Kombi-Abonnement

Mit e.Med Innere Medizin erhalten Sie Zugang zu CME-Fortbildungen des Fachgebietes Innere Medizin, den Premium-Inhalten der internistischen Fachzeitschriften, inklusive einer gedruckten internistischen Zeitschrift Ihrer Wahl.

e.Med Allgemeinmedizin

Kombi-Abonnement

Mit e.Med Allgemeinmedizin erhalten Sie Zugang zu allen CME-Fortbildungen und Premium-Inhalten der allgemeinmedizinischen Zeitschriften, inklusive einer gedruckten Allgemeinmedizin-Zeitschrift Ihrer Wahl.​​​​​​​​​​​​​​

Zusatzmaterial
Supplementary material 1 (DOCX 19 kb)
705_2018_4131_MOESM1_ESM.docx
Literatur
Über diesen Artikel

Weitere Artikel der Ausgabe 3/2019

Archives of Virology 3/2019 Zur Ausgabe

Neu im Fachgebiet Innere Medizin

Meistgelesene Bücher aus der Inneren Medizin

2017 | Buch

Rheumatologie aus der Praxis

Entzündliche Gelenkerkrankungen – mit Fallbeispielen

Dieses Fachbuch macht mit den wichtigsten chronisch entzündlichen Gelenk- und Wirbelsäulenerkrankungen vertraut. Anhand von über 40 instruktiven Fallbeispielen werden anschaulich diagnostisches Vorgehen, therapeutisches Ansprechen und der Verlauf …

Herausgeber:
Rudolf Puchner

2016 | Buch

Ambulant erworbene Pneumonie

Was, wann, warum – Dieses Buch bietet differenzierte Diagnostik und Therapie der ambulant erworbenen Pneumonie zur sofortigen sicheren Anwendung. Entsprechend der neuesten Studien und Leitlinien aller wichtigen Fachgesellschaften.

Herausgeber:
Santiago Ewig

Mail Icon II Newsletter

Bestellen Sie unseren kostenlosen Newsletter Update Innere Medizin und bleiben Sie gut informiert – ganz bequem per eMail.

© Springer Medizin 

Bildnachweise