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Erschienen in: Bundesgesundheitsblatt - Gesundheitsforschung - Gesundheitsschutz 3/2016

01.03.2016 | Leitthema

Vernetzung von Biobanken großer europäischer Kohorten (EU-Projekt BBMRI-LPC)

verfasst von: Klaus A. Kuhn, Raffael Bild, Gabriele Anton, Simone Schuffenhauer, H-Erich Wichmann

Erschienen in: Bundesgesundheitsblatt - Gesundheitsforschung - Gesundheitsschutz | Ausgabe 3/2016

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Zusammenfassung

Hintergrund

In Ergänzung zu BBMRI, das eine europäische Forschungsinfrastruktur für Biobanken aufbaut, werden in BBMRI-LPC die großen europäischen prospektiven Studien vernetzt, um länderübergreifende Forschung zu wichtigen Krankheitsgruppen und zur Gesundheitsvorsorge zu ermöglichen. Ein Instrument hierfür ist die Datenbankanwendung „LPC Catalogue“, die den Zugang zu Biomaterialien der beteiligten Kohorten unterstützt.

Ziel der Arbeit

Mit dem „LPC Catalogue“ wird ein im Einsatz befindliches und relevantes Werkzeug zur Vernetzung von Biobanken vorgestellt. Der LPC Catalogue wurde zudem erweitert, um Kompatibilität zu dem Standard MIABIS herzustellen und um die Suchmöglichkeiten zu verbessern. Diese Arbeit beschreibt den LPC Catalogue, seinen organisatorisch-technischen Rahmen und die genannten Weiterentwicklungen.

Material und Methoden

Der LPC Catalogue dient einer strukturierten Übersicht über die teilnehmenden Kohorten. Er stellt verschiedene Abfragemöglichkeiten und eine Suchfunktion zur Verfügung. Zur Erweiterung der Suchmöglichkeiten wurde ein neues Modul entwickelt, das hier als „Datenwürfel“ bezeichnet wird. Die Bereitstellung von Daten aufseiten der Kohorten wird durch eine „Konnektor“-Komponente unterstützt.

Ergebnisse

Der LPC Catalogue wurde mit Daten von 22 Kohorten mit mehr als 3,8 Mio. Bioproben befüllt. Für den „Würfel“ wurden aktuell Daten von 3 Kohorten erhoben, der Ausbau läuft. Derzeit werden BBMRI-LPC-Ausschreibungen für wissenschaftliche Projekte, die die Proben und Daten der beteiligten Kohorten nutzen, durchgeführt. In deren Rahmen wurden bereits mehrere Anträge bewilligt.

Diskussion

Der LPC Catalogue unterstützt den transnationalen Zugang zu Bioproben. Ein Vergleich mit verfügbaren Lösungen zeigt die Relevanz seiner Funktionalität.
Literatur
1.
Zurück zum Zitat Yuille M, van Ommen G-J, Bréchot C et al (2008) Biobanking for Europe. Brief Bioinform 9(1):14–24CrossRefPubMed Yuille M, van Ommen G-J, Bréchot C et al (2008) Biobanking for Europe. Brief Bioinform 9(1):14–24CrossRefPubMed
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Metadaten
Titel
Vernetzung von Biobanken großer europäischer Kohorten (EU-Projekt BBMRI-LPC)
verfasst von
Klaus A. Kuhn
Raffael Bild
Gabriele Anton
Simone Schuffenhauer
H-Erich Wichmann
Publikationsdatum
01.03.2016
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
Erschienen in
Bundesgesundheitsblatt - Gesundheitsforschung - Gesundheitsschutz / Ausgabe 3/2016
Print ISSN: 1436-9990
Elektronische ISSN: 1437-1588
DOI
https://doi.org/10.1007/s00103-015-2300-9

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