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Archives of Virology

Erschienen in:

01.10.2008 | Brief Report

Cleavage sites of the “P3 region” in the nonstructural polyprotein precursor of a dicistrovirus

verfasst von: Nobuhiko Nakashima, Yuri Nakamura

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 10/2008

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Abstract

Plautia stali intestine virus (PSIV) is a member of the family Dicistroviridae. Dicistroviruses, like picornaviruses, are thought to encode a 3C-like protease; however, the cleavage sites of dicistroviral nonstructural polyprotein precursors are unknown except for those in genome-linked virus protein (VPg) regions. We expressed part of the PSIV polyprotein in Escherichia coli and detected autoprocessed viral proteins. N-terminal sequence analysis of the autoprocessed proteins showed that Q/GWLSW and Q/NGVFD in the PSIV sequence correspond to 2C/3A and 3C/3D cleavage sites in picornaviruses. Alignments of deduced amino acid sequences of the “P3 region” suggest that these cleavage sites can be predicted.

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Titel: Cleavage sites of the “P3 region” in the nonstructural polyprotein precursor of a dicistrovirus
verfasst von: Nobuhiko Nakashima
Yuri Nakamura
Publikationsdatum: 01.10.2008
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 10/2008
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-008-0208-5

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