Skip to main content
Erschienen in: Archives of Virology 2/2015

01.02.2015 | Annotated Sequence Record

Complete genome sequence of motherwort yellow mottle virus, a novel putative member of the genus Torradovirus

verfasst von: Jang-Kyun Seo, Minji Kang, Hae-Ryun Kwak, Mi-Kyeong Kim, Chang-Seok Kim, Su-Heon Lee, Jeong-Soo Kim, Hong-Soo Choi

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 2/2015

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

The complete genome sequence of a new virus isolated from a motherwort plant exhibiting yellow mottle, mild mosaic, and stunting symptoms in Andong, Korea, was determined. The genome of this virus is composed of two single-stranded RNAs (7068 and 4963 nucleotides in length, respectively) carrying poly(A) tails. RNA1 contains one large open reading frame (RNA1-ORF1), while two potential ORFs (RNA2-ORF1 and RNA2-ORF2) were found in RNA2. BLAST searches of protein databases showed that RNA1-ORF1 and RNA2-ORF2 have maximum amino acid sequence identities of 53 % and 57 % to the RNA1-ORF1 and RNA2-ORF2, respectively, of lettuce necrotic leaf curl virus (LNLCV, a recently identified torradovirus). Phylogenetic analysis provided further evidence that the virus identified in this study is probably a member of a new species in the genus Torradovirus. The name “motherwort yellow mottle virus” (MYMoV) is proposed for this new virus.
Literatur
1.
Zurück zum Zitat Adams MJ, King AM, Carstens EB (2013) Ratification vote on taxonomic proposals to the International Committee on Taxonomy of Viruses (2013). Arch Virol 158:2023–2030PubMedCrossRef Adams MJ, King AM, Carstens EB (2013) Ratification vote on taxonomic proposals to the International Committee on Taxonomy of Viruses (2013). Arch Virol 158:2023–2030PubMedCrossRef
2.
Zurück zum Zitat Barbosa JC, Eckstein B, Bergamin Filho A, Rezende JAM, Dallagnol LJ (2013) First report of tomato yellow spot virus infecting Leonurus sibiricus in Brazil. Plant Dis 97:289CrossRef Barbosa JC, Eckstein B, Bergamin Filho A, Rezende JAM, Dallagnol LJ (2013) First report of tomato yellow spot virus infecting Leonurus sibiricus in Brazil. Plant Dis 97:289CrossRef
3.
Zurück zum Zitat Batuman O, Kuo YW, Palmieri M, Rojas MR, Gilbertson RL (2010) Tomato chocolate spot virus, a member of a new torradovirus species that causes a necrosis-associated disease of tomato in Guatemala. Arch Virol 155:857–869PubMedCentralPubMedCrossRef Batuman O, Kuo YW, Palmieri M, Rojas MR, Gilbertson RL (2010) Tomato chocolate spot virus, a member of a new torradovirus species that causes a necrosis-associated disease of tomato in Guatemala. Arch Virol 155:857–869PubMedCentralPubMedCrossRef
4.
Zurück zum Zitat Islam MA, Ahmed F, Das AK, Bachar SC (2005) Analgesic and anti-inflammatory activity of Leonurus sibiricus. Fitoterapia 76:359–362PubMedCrossRef Islam MA, Ahmed F, Das AK, Bachar SC (2005) Analgesic and anti-inflammatory activity of Leonurus sibiricus. Fitoterapia 76:359–362PubMedCrossRef
5.
Zurück zum Zitat Schelhorn SE, Fischer M, Tolosi L, Altmuller J, Nurnberg P, Pfister H, Lengauer T, Berthold F (2013) Sensitive detection of viral transcripts in human tumor transcriptomes. PLoS Comput Biol 9:e1003228PubMedCentralPubMedCrossRef Schelhorn SE, Fischer M, Tolosi L, Altmuller J, Nurnberg P, Pfister H, Lengauer T, Berthold F (2013) Sensitive detection of viral transcripts in human tumor transcriptomes. PLoS Comput Biol 9:e1003228PubMedCentralPubMedCrossRef
6.
Zurück zum Zitat Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S (2011) MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol 28:2731–2739PubMedCentralPubMedCrossRef Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S (2011) MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol 28:2731–2739PubMedCentralPubMedCrossRef
7.
Zurück zum Zitat Turina M, Ricker MD, Lenzi R, Masenga V, Ciuffo M (2007) A severe disease of tomato in the Culiacan area (Sinaloa, Mexico) is caused by a new picorna-like viral species. Plant Dis 91:932–941CrossRef Turina M, Ricker MD, Lenzi R, Masenga V, Ciuffo M (2007) A severe disease of tomato in the Culiacan area (Sinaloa, Mexico) is caused by a new picorna-like viral species. Plant Dis 91:932–941CrossRef
8.
Zurück zum Zitat Verbeek M, Dullemans AM, van den Heuvel JF, Maris PC, van der Vlugt RA (2007) Identification and characterisation of tomato torrado virus, a new plant picorna-like virus from tomato. Arch Virol 152:881–890PubMedCentralPubMedCrossRef Verbeek M, Dullemans AM, van den Heuvel JF, Maris PC, van der Vlugt RA (2007) Identification and characterisation of tomato torrado virus, a new plant picorna-like virus from tomato. Arch Virol 152:881–890PubMedCentralPubMedCrossRef
9.
Zurück zum Zitat Verbeek M, Dullemans AM, van den Heuvel JF, Maris PC, van der Vlugt RA (2008) Tomato marchitez virus, a new plant picorna-like virus from tomato related to tomato torrado virus. Arch Virol 153:127–134PubMedCrossRef Verbeek M, Dullemans AM, van den Heuvel JF, Maris PC, van der Vlugt RA (2008) Tomato marchitez virus, a new plant picorna-like virus from tomato related to tomato torrado virus. Arch Virol 153:127–134PubMedCrossRef
10.
Zurück zum Zitat Verbeek M, Dullemans A, van den Heuvel H, Maris P, van der Vlugt R (2010) Tomato chocolate virus: a new plant virus infecting tomato and a proposed member of the genus Torradovirus. Arch Virol 155:751–755PubMedCentralPubMedCrossRef Verbeek M, Dullemans A, van den Heuvel H, Maris P, van der Vlugt R (2010) Tomato chocolate virus: a new plant virus infecting tomato and a proposed member of the genus Torradovirus. Arch Virol 155:751–755PubMedCentralPubMedCrossRef
11.
Zurück zum Zitat Verbeek M, Dullemans AM, van Raaij HM, Verhoeven JT, van der Vlugt RA (2014) Lettuce necrotic leaf curl virus, a new plant virus infecting lettuce and a proposed member of the genus Torradovirus. Arch Virol 159:801–805PubMedCrossRef Verbeek M, Dullemans AM, van Raaij HM, Verhoeven JT, van der Vlugt RA (2014) Lettuce necrotic leaf curl virus, a new plant virus infecting lettuce and a proposed member of the genus Torradovirus. Arch Virol 159:801–805PubMedCrossRef
Metadaten
Titel
Complete genome sequence of motherwort yellow mottle virus, a novel putative member of the genus Torradovirus
verfasst von
Jang-Kyun Seo
Minji Kang
Hae-Ryun Kwak
Mi-Kyeong Kim
Chang-Seok Kim
Su-Heon Lee
Jeong-Soo Kim
Hong-Soo Choi
Publikationsdatum
01.02.2015
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 2/2015
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-014-2254-5

Weitere Artikel der Ausgabe 2/2015

Archives of Virology 2/2015 Zur Ausgabe

Leitlinien kompakt für die Innere Medizin

Mit medbee Pocketcards sicher entscheiden.

Seit 2022 gehört die medbee GmbH zum Springer Medizin Verlag

Notfall-TEP der Hüfte ist auch bei 90-Jährigen machbar

26.04.2024 Hüft-TEP Nachrichten

Ob bei einer Notfalloperation nach Schenkelhalsfraktur eine Hemiarthroplastik oder eine totale Endoprothese (TEP) eingebaut wird, sollte nicht allein vom Alter der Patientinnen und Patienten abhängen. Auch über 90-Jährige können von der TEP profitieren.

Niedriger diastolischer Blutdruck erhöht Risiko für schwere kardiovaskuläre Komplikationen

25.04.2024 Hypotonie Nachrichten

Wenn unter einer medikamentösen Hochdrucktherapie der diastolische Blutdruck in den Keller geht, steigt das Risiko für schwere kardiovaskuläre Ereignisse: Darauf deutet eine Sekundäranalyse der SPRINT-Studie hin.

Bei schweren Reaktionen auf Insektenstiche empfiehlt sich eine spezifische Immuntherapie

Insektenstiche sind bei Erwachsenen die häufigsten Auslöser einer Anaphylaxie. Einen wirksamen Schutz vor schweren anaphylaktischen Reaktionen bietet die allergenspezifische Immuntherapie. Jedoch kommt sie noch viel zu selten zum Einsatz.

Therapiestart mit Blutdrucksenkern erhöht Frakturrisiko

25.04.2024 Hypertonie Nachrichten

Beginnen ältere Männer im Pflegeheim eine Antihypertensiva-Therapie, dann ist die Frakturrate in den folgenden 30 Tagen mehr als verdoppelt. Besonders häufig stürzen Demenzkranke und Männer, die erstmals Blutdrucksenker nehmen. Dafür spricht eine Analyse unter US-Veteranen.

Update Innere Medizin

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.