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Archives of Virology
Erschienen in: Archives of Virology 3/2016

01.03.2016 | Annotated Sequence Record

Complete genomic sequence of barley (Hordeum vulgare) endornavirus (HvEV) determined by next-generation sequencing

verfasst von: Thierry Candresse, Armelle Marais, Roberto Sorrentino, Chantal Faure, Sébastien Theil, Valérie Cadot, Mathieu Rolland, Julie Villemot, Frank Rabenstein

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 3/2016

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Abstract

Endornaviruses are unusual plant-, fungus- and oomycete-infecting viruses with a large, ca 14- to 17-kb linear double-stranded RNA (dsRNA) genome and a persistent lifestyle. The complete genome sequence of an endornavirus from the barley (Hordeum vulgare) Nerz variety was determined from paired Illumina MySeq reads derived from purified dsRNAs. The genome is 14,243 nt long, with 5’ and 3’ non-coding regions of 207 and 47 nt, respectively. It encodes a single large protein of 4663 amino acids that carries conserved motifs for a methyltransferase, a helicase and an RNA-dependent RNA polymerase. The sequence of Hordeum vulgare endornavirus (HvEV) carries all the hallmarks of a typical member of the genus Endornavirus, with the exception of an UDP-glycosyltransferase motif observed in many, but not all, endornaviral genomes.
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Metadaten
Titel
Complete genomic sequence of barley (Hordeum vulgare) endornavirus (HvEV) determined by next-generation sequencing
verfasst von
Thierry Candresse
Armelle Marais
Roberto Sorrentino
Chantal Faure
Sébastien Theil
Valérie Cadot
Mathieu Rolland
Julie Villemot
Frank Rabenstein
Publikationsdatum
01.03.2016
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 3/2016
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-015-2709-3

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