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Erschienen in:

12.09.2016 | Brief Report

Identification of further diversity among posaviruses

verfasst von: Kaori Sano, Yuki Naoi, Mai Kishimoto, Tsuneyuki Masuda, Hitomi Tanabe, Mika Ito, Kazutaka Niira, Kei Haga, Keigo Asano, Shinobu Tsuchiaka, Tsutomu Omatsu, Tetsuya Furuya, Yukie Katayama, Mami Oba, Yoshinao Ouchi, Hiroshi Yamasato, Motohiko Ishida, Junsuke Shirai, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Makoto Nagai

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 12/2016

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Abstract

Recently, there have been reports of new members of posavirus-like viruses in the order Picornavirales. In this study, using a metagenomics approach, 11 posavirus-like sequences (>7,000 nucleotides) were detected in 155 porcine fecal samples. Phylogenetic analysis revealed that the newly identified virus sequences, together with other posavirus-like viruses, form distinct clusters within the order Picornavirales, composed of eight genogroups and unassigned sequences based on amino acid sequences of the helicase and RNA-dependent RNA polymerase regions, with <40 % and <50 % sequence identity, respectively. We propose further classifications of highly diverse posavirus populations based on newly identified sequences from Japanese pig feces.

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Titel: Identification of further diversity among posaviruses
verfasst von: Kaori Sano
Yuki Naoi
Mai Kishimoto
Tsuneyuki Masuda
Hitomi Tanabe
Mika Ito
Kazutaka Niira
Kei Haga
Keigo Asano
Shinobu Tsuchiaka
Tsutomu Omatsu
Tetsuya Furuya
Yukie Katayama
Mami Oba
Yoshinao Ouchi
Hiroshi Yamasato
Motohiko Ishida
Junsuke Shirai
Kazuhiko Katayama
Tetsuya Mizutani
Makoto Nagai
Publikationsdatum: 12.09.2016
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 12/2016
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-016-3048-8

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