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Erschienen in: Archives of Virology 1/2018

19.10.2017 | Annotated Sequence Record

Complete genome sequence of maize yellow striate virus, a new cytorhabdovirus infecting maize and wheat crops in Argentina

verfasst von: Fernanda Maurino, Analía D. Dumón, Gabriela Llauger, Vanina Alemandri, Luis A. de Haro, M. Fernanda Mattio, Mariana del Vas, Irma Graciela Laguna, María de la Paz Giménez Pecci

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 1/2018

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Abstract

A rhabdovirus infecting maize and wheat crops in Argentina was molecularly characterized. Through next-generation sequencing (NGS) of symptomatic leaf samples, the complete genome was obtained of two isolates of maize yellow striate virus (MYSV), a putative new rhabdovirus, differing by only 0.4% at the nucleotide level. The MYSV genome consists of 12,654 nucleotides for maize and wheat virus isolates, and shares 71% nucleotide sequence identity with the complete genome of barley yellow striate mosaic virus (BYSMV, NC028244). Ten open reading frames (ORFs) were predicted in the MYSV genome from the antigenomic strand and were compared with their BYSMV counterparts. The highest amino acid sequence identity of the MYSV and BYSMV proteins was 80% between the L proteins, and the lowest was 37% between the proteins 4. Phylogenetic analysis suggested that the MYSV isolates are new members of the genus Cytorhabdovirus, family Rhabdoviridae. Yellow striate, affecting maize and wheat crops in Argentina, is an emergent disease that presents a potential economic risk for these widely distributed crops.
Literatur
2.
Zurück zum Zitat Maurino MF, Laguna G, Giolitti F et al (2012) First ocurrence of a rhabdovirus infecting maize in Argentina. Plant Dis 96:1383CrossRef Maurino MF, Laguna G, Giolitti F et al (2012) First ocurrence of a rhabdovirus infecting maize in Argentina. Plant Dis 96:1383CrossRef
3.
Zurück zum Zitat Dumón AD, Mattio MF, Argüello-Caro EB et al (2015) Occurrence of a closely-related isolate to Maize yellow striate virus in wheat plants. Agriscientia 32:107–112 Dumón AD, Mattio MF, Argüello-Caro EB et al (2015) Occurrence of a closely-related isolate to Maize yellow striate virus in wheat plants. Agriscientia 32:107–112
7.
Zurück zum Zitat Lander ES, Waterman MS (1988) Genomic mapping by fingerprinting random clones: a mathematical analysis. Genomics 2:231–239CrossRefPubMed Lander ES, Waterman MS (1988) Genomic mapping by fingerprinting random clones: a mathematical analysis. Genomics 2:231–239CrossRefPubMed
9.
Zurück zum Zitat Yan T, Zhu J-R, Di D et al (2015) Characterization of the complete genome of Barley yellow striate mosaic virus reveals a nested gene encoding a small hydrophobic protein. Virology 478:112–122CrossRefPubMed Yan T, Zhu J-R, Di D et al (2015) Characterization of the complete genome of Barley yellow striate mosaic virus reveals a nested gene encoding a small hydrophobic protein. Virology 478:112–122CrossRefPubMed
10.
Zurück zum Zitat Tanno F, Nakatsu A, Toriyama SS, Koyima M (2000) Complete nucleotide sequence of Northern cereal mosaic virus and its genome organization. Arch Virol 145:1373–1384CrossRefPubMed Tanno F, Nakatsu A, Toriyama SS, Koyima M (2000) Complete nucleotide sequence of Northern cereal mosaic virus and its genome organization. Arch Virol 145:1373–1384CrossRefPubMed
13.
Zurück zum Zitat Klerks MM, Lindner JL, Vaskova D et al (2004) Detection and tentative grouping of Strawberry crinkle virus isolates. Eur J Plant Pathol 110:45–52CrossRef Klerks MM, Lindner JL, Vaskova D et al (2004) Detection and tentative grouping of Strawberry crinkle virus isolates. Eur J Plant Pathol 110:45–52CrossRef
15.
Zurück zum Zitat Dietzgen RG, Kuhn JH, Clawson AN et al (2014) Dichorhavirus: a proposed new genus for Brevipalpus mite-transmitted, nuclear, bacilliform, bipartite, negative-strand RNA plant viruses. Arch Virol 159:607–619. doi:10.1007/s00705-013-1834-0 CrossRefPubMed Dietzgen RG, Kuhn JH, Clawson AN et al (2014) Dichorhavirus: a proposed new genus for Brevipalpus mite-transmitted, nuclear, bacilliform, bipartite, negative-strand RNA plant viruses. Arch Virol 159:607–619. doi:10.​1007/​s00705-013-1834-0 CrossRefPubMed
Metadaten
Titel
Complete genome sequence of maize yellow striate virus, a new cytorhabdovirus infecting maize and wheat crops in Argentina
verfasst von
Fernanda Maurino
Analía D. Dumón
Gabriela Llauger
Vanina Alemandri
Luis A. de Haro
M. Fernanda Mattio
Mariana del Vas
Irma Graciela Laguna
María de la Paz Giménez Pecci
Publikationsdatum
19.10.2017
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 1/2018
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-017-3579-7

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