nach oben

Erschienen in:

25.10.2019 | Case Report

Next-generation sequencing technology as a powerful detection and semi-quantitative method for herpes simplex virus type 1 in pediatric encephalitis

verfasst von: Lin-lin Liu, Ling-yun Guo, Jie Dong, Wen-hua Huang, Li Zhao, Bing Liu, Xi-xi Zhang, Yong-qiang Jiang, Gang Liu

Erschienen in: Journal of NeuroVirology | Ausgabe 2/2020

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

This case report presents a 1-year-old boy from China, with sudden onset of fever, convulsion, and sleepiness, screened for viral DNA in blood and cerebrospinal fluid (CSF) sample using next-generation sequencing (NGS) to diagnose herpes simplex virus type 1 (HSV-1) encephalitis, further validated by PCR. After acyclovir treatment, the patient’s symptom disappeared and HSV-1 DNA unique reads decreased from 4290 to zero in CSF, and from 23 to zero in blood detected by NGS. The clinical presentation and outcome were consistent with the pathogenic diagnostic results of NGS. NGS of CSF samples can be used as a diagnostic assay for HSV-1 encephalitis and also might be a semi-quantitative method for evaluation of treatment effect.

Nur mit Berechtigung zugänglich

Ai JW, Zhang HC, Cui P, Xu B, Gao Y, Cheng Q, Li T, Wu H, Zhang WH (2018) Dynamic and direct pathogen load surveillance to monitor disease progression and therapeutic efficacy in central nervous system infection using a novel semi-quantitive sequencing platform. J Inf Secur 76(3):307–310. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2017.11.002 CrossRef

Brown JR, Bharucha T, Breuer J (2018) Encephalitis diagnosis using metagenomics: application of next generation sequencing for undiagnosed cases. J Inf Secur 76(3):225–240. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2017.12.014 CrossRef

De Tiège X, Rozenberg F, Des Portes V, Lobut JB, Lebon P, Ponsot G, Héron B (2003) Herpes simplex encephalitis relapses in children: differentiation of two neurologic entities. Neurology 61(2):241–243CrossRefPubMed

Fujii H, Kakiuchi S, Tsuji M, Nishimura H, Yoshikawa T, Yamada S, Omura N, Inagaki T, Shibamura M, Harada S, Taniguchi S, Saijo M (2018) Application of next-generation sequencing to detect acyclovir-resistant herpes simplex virus type 1 variants at low frequency in thymidine kinase gene of the isolates recovered from patients with hematopoietic stem cell transplantation. J Virol Methods 251:123–128. https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2017.10.019 CrossRefPubMed

Granerod J, Ambrose HE, Davies NW, Clewley JP, Walsh AL, Morgan D, Cunningham R, Zuckerman M, Mutton KJ, Solomon T, Ward KN, Lunn MP, Irani SR, Vincent A, Brown DW, Crowcroft NS, UK Health Protection Agency (HPA) Aetiology of Encephalitis Study Group (2010) Causes of encephalitis and differences in their clinical presentations in England: a multicentre, population based prospective study. Lancet Infect Dis 10:835–844. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(10)70222-X CrossRefPubMed

Guan H, Shen A, Lv X, Yang X, Ren H, Zhao Y, Zhang Y, Gong Y, Ni P, Wu H, Zhu Y, Cui L (2016) Detection of virus in CSF from the cases with meningoencephalitis by next-generation sequencing. J Neuro-Oncol 22(2):240–245. https://doi.org/10.1007/s13365-015-0390-7 CrossRef

Guo LY, Feng WY, Guo X, Liu B, Liu G, Dong J (2018) The advantages of next-generation sequencing technology in the detection of different sources of abscess. J Inf Secur 78:75–86. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2018.08.002 CrossRef

Inagaki T, Satoh M, Fujii H, Yamada S, Shibamura M, Yoshikawa T, Harada S, Takeyama H, Saijo M (2018) Acyclovir sensitivity and neurovirulence of herpes simplex virus type 1 with amino acid substitutions in the viral thymidine kinase gene, which were detected in the patients with intractable herpes simplex encephalitis previously reported. Jpn J Infect Dis 71(5):343–349. https://doi.org/10.7883/yoken.JJID.2018.176 CrossRefPubMed

Messacar K, Fischer M, Dominguez SR, Tyler KL, Abzug MJ (2018) Encephalitis in US children. Infect Dis Clin N Am 32(1):145–162. https://doi.org/10.1016/j.idc.2017.10.007 CrossRef

Tunkel AR, Glaser CA, Bloch KC, Sejvar JJ, Marra CM, Roos KL, Hartman BJ, Kaplan SL, Scheld WM, Whitley RJ, Infectious Diseases Society of America (2008) The management of encephalitis: clinical practice guidelines by the Infectious Diseases Society of America. Clin Infect Dis 47(3):303–327. https://doi.org/10.1086/589747 CrossRefPubMed

Valencia I, Miles DK, Melvin J, Khurana D, Kothare S, Hardison H, Legido A (2004) Relapse of herpes encephalitis after acyclovir therapy: report of two new cases and review of the literature. Neuropediatrics 35:371–376CrossRefPubMed

Wilson MR, Naccache SN, Samayoa E, Biagtan M, Bashir H, Yu G, Salamat SM, Somasekar S, Federman S, Miller S, Sokolic R, Garabedian E, Candotti F, Buckley RH, Reed KD, Meyer TL, Seroogy CM, Galloway R, Henderson SL, Gern JE, DeRisi JL, Chiu CY (2014) Actionable diagnosis of neuroleptospirosis by next-generation sequencing. N Engl J Med 370:2408–2417. https://doi.org/10.1056/NEJMoa1401268 CrossRefPubMedPubMedCentral

Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY (2019) Clinical metagenomic sequencing for diagnosis of meningitis and encephalitis. N Engl J Med 380(24):2327–2340. https://doi.org/10.1056/NEJMoa1803396 CrossRefPubMedPubMedCentral

Titel: Next-generation sequencing technology as a powerful detection and semi-quantitative method for herpes simplex virus type 1 in pediatric encephalitis
verfasst von: Lin-lin Liu
Ling-yun Guo
Jie Dong
Wen-hua Huang
Li Zhao
Bing Liu
Xi-xi Zhang
Yong-qiang Jiang
Gang Liu
Publikationsdatum: 25.10.2019
Verlag: Springer International Publishing
Erschienen in: Journal of NeuroVirology / Ausgabe 2/2020
Print ISSN: 1355-0284
Elektronische ISSN: 1538-2443
DOI: https://doi.org/10.1007/s13365-019-00803-5

Leitlinien kompakt für die Neurologie

Mit medbee Pocketcards sicher entscheiden.

^{Seit 2022 gehört die medbee GmbH zum Springer Medizin Verlag}

Kostenlos registrieren

Neu im Fachgebiet Neurologie

Akuter Schwindel: Wann lohnt sich eine MRT?

28.04.2024 Schwindel Nachrichten

Akuter Schwindel stellt oft eine diagnostische Herausforderung dar. Wie nützlich dabei eine MRT ist, hat eine Studie aus Finnland untersucht. Immerhin einer von sechs Patienten wurde mit akutem ischämischem Schlaganfall diagnostiziert.

Niedriger diastolischer Blutdruck erhöht Risiko für schwere kardiovaskuläre Komplikationen

25.04.2024 Hypotonie Nachrichten

Wenn unter einer medikamentösen Hochdrucktherapie der diastolische Blutdruck in den Keller geht, steigt das Risiko für schwere kardiovaskuläre Ereignisse: Darauf deutet eine Sekundäranalyse der SPRINT-Studie hin.

Frühe Alzheimertherapie lohnt sich

25.04.2024 AAN-Jahrestagung 2024 Nachrichten

Ist die Tau-Last noch gering, scheint der Vorteil von Lecanemab besonders groß zu sein. Und beginnen Erkrankte verzögert mit der Behandlung, erreichen sie nicht mehr die kognitive Leistung wie bei einem früheren Start. Darauf deuten neue Analysen der Phase-3-Studie Clarity AD.

Viel Bewegung in der Parkinsonforschung

25.04.2024 Parkinson-Krankheit Nachrichten

Neue arznei- und zellbasierte Ansätze, Frühdiagnose mit Bewegungssensoren, Rückenmarkstimulation gegen Gehblockaden – in der Parkinsonforschung tut sich einiges. Auf dem Deutschen Parkinsonkongress ging es auch viel um technische Innovationen.

Update Neurologie

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.

Newsletter bestellen

Springer Medizin

Abstract

Bitte loggen Sie sich ein, um Zugang zu diesem Inhalt zu erhalten

Weitere Artikel der Ausgabe 2/2020

Detecting cognitive impairment in HIV-infected individuals using mutual connectivity analysis of resting state functional MRI

Cerebrospinal fluid pleocytosis as a predictive factor for CSF and plasma HIV RNA discordance and escape

Resting-state neural signatures of depressive symptoms in acute HIV

Genome-based analysis of SFTSV causing severe encephalitis with brain lesions

Diagnosing acute encephalitis in patients with hematological disorders: caveats and pitfalls

Concomitant cerebral aspergillosis and mucormycosis in an immunocompetent woman treated with corticosteroids