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Die Pathologie

Erschienen in:

04.04.2018 | Schwerpunkt: Pathologie und Forschungsbiobanken

Präanalytik und Biobanking

Einfluss präanalytischer Faktoren auf die Gewebeprobenqualität

verfasst von: K.-F. Becker, J. Wipperfürth, Prof. Dr. E. Herpel

Erschienen in: Die Pathologie | Ausgabe 4/2018

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Zusammenfassung

Der Zugang zu gut charakterisierten menschlichen Bioproben ist eine der wichtigsten Voraussetzungen für die moderne biomedizinische Forschung. Biobanken spielen hier eine entscheidende Rolle, da sie entsprechende Bioproben für geplante Analysen zur Verfügung stellen. Hierfür müssen viele Störfaktoren, die die Qualität von Bioproben beeinflussen, beachtet werden. Neben logistischen, ethischen und datenschutzrechtlichen Aspekten sind hier v. a. präanalytische Variablen im Rahmen der Probengewinnung, Verarbeitung und Lagerung zu nennen. Im vorliegenden Paper werden daher die wichtigsten präanalytischen Einflussfaktoren systematisch dargestellt. Außerdem geben wir einen Überblick über aktuelle nationale und internationale Aktivitäten zur standardisierten Erfassung der präanalytischen Variablen, um deren Einfluss auf das Analyseergebnis besser zu verstehen und in Zukunft zu minimieren.

Asslaber M, Abuja PM, Stark K et al (2007) The Genome Austria Tissue Bank (GATiB). Pathobiology 74(4):251–258CrossRefPubMed

Betsou F, Lehmann S, Ashton G et al (2010) Standard preanalytical coding for biospecimens: defining the sample PREanalytical code. Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive. Oncology 19(4):1004–1011

Bevilacqua G, Bosman F, Dassesse T et al (2010) The role of the pathologist in tissue banking: European Consensus Expert Group Report. Virchows Arch 456(4):449–454CrossRefPubMedPubMedCentral

Boellner S, Becker KF (2015) Recent progress in protein profiling of clinical tissues for next-generation molecular diagnostics. Expert Rev Mol Diagn 15(10):1277–1292CrossRefPubMed

Caixeiro NJ, Lai K, Lee CS (2016) Quality assessment and preservation of RNA from biobank tissue specimens: a systematic review. J Clin Pathol 69(3):260–265CrossRefPubMed

Carraro P, Plebani M (2007) Errors in a stat laboratory: types and frequencies 10 years later. Clin Chem 53(7):1338–1342CrossRefPubMed

Ellervik C, Vaught J (2015) Preanalytical variables affecting the integrity of human biospecimens in biobanking. Clin Chem 61(7):914–934CrossRefPubMed

Espina V, Edmiston KH, Heiby M et al (2008) A portrait of tissue phosphoprotein stability in the clinical tissue procurement process. Mol Cell Proteomics 7(10):1998–2018CrossRefPubMedPubMedCentral

Ferguson RE, Hochstrasser DF, Banks RE (2007) Impact of preanalytical variables on the analysis of biological fluids in proteomic studies. Proteomics Clin Appl 1(8):739–746CrossRefPubMed

10.

Gaskins AJ, Wilchesky M, Mumford SL et al (2012) Endogenous reproductive hormones and C‑reactive protein across the menstrual cycle: the BioCycle Study. Am J Epidemiol 175(5):423–431CrossRefPubMedPubMedCentral

11.

Gnanapragasam VJ (2010) Unlocking the molecular archive: the emerging use of formalin-fixed paraffin-embedded tissue for biomarker research in urological cancer. BJU Int 105(2):274–278CrossRefPubMed

12.

Goswami RS, Luthra R, Singh RR et al (2016) Identification of factors affecting the success of next-generation sequencing testing in solid tumors. Am J Clin Pathol 145(2):222–237CrossRefPubMed

13.

Gundisch S, Hauck S, Sarioglu H et al (2012) Variability of protein and phosphoprotein levels in clinical tissue specimens during the preanalytical phase. J Proteome Res 11(12):5748–5762CrossRefPubMed

14.

Herpel E, Koleganova N, Schirmacher P (2008) Tissue bank of the National Centre for Tumour Disease. An innovative platform for translational tumour. Pathologe 29(Suppl 2):204–209CrossRefPubMed

15.

Herpel E, Schmitt S, Kiehntopf M (2016) Quality of biomaterials in liquid- and tissue-biobanking. Bundesgesundheitsblatt Gesundheitsforschung Gesundheitsschutz 59(3):325–335CrossRefPubMed

16.

Kiehntopf M, Krawczak M (2011) Biobanking and international interoperability: samples. Hum Genet 130(3):369–376CrossRefPubMed

17.

Kokkat TJ, McGarvey D, Patel MS et al (2013) Protein extraction from methanol fixed paraffin embedded tissue blocks: a new possibility using cell blocks. Cytojournal 10:23CrossRefPubMedPubMedCentral

18.

Kokkat TJ, Patel MS, McGarvey D et al (2013) Archived formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) blocks: a valuable underexploited resource for extraction of DNA, RNA, and protein. Biopreserv Biobank 11(2):101–106CrossRefPubMedPubMedCentral

19.

Livesey JH, Ellis MJ, Evans MJ (2008) Pre-analytical requirements. Clin Biochem Rev 29(Suppl 1):S11–S15PubMedPubMedCentral

20.

Kynast LK, Volk N, Fleming T et al (2017) Diabetes-associated biobanking: more topical than ever? Exp Clin Endocrinol Diabetes 125(9):603–609CrossRef

21.

Meric-Bernstam F, Akcakanat A, Chen H et al (2014) Influence of biospecimen variables on proteomic biomarkers in breast cancer. Clin Cancer Res 20(14):3870–3883CrossRefPubMedPubMedCentral

22.

Morrin H, Gunningham S, Currie M et al (2005) The christchurch tissue bank to support cancer research. N Z Med J 118(1225):U1735PubMed

23.

Nanni U, Betsou F, Riondino S et al (2012) SPRECware: software tools for Standard PREanalytical Code (SPREC) labeling – effective exchange and search of stored biospecimens. Int J Biol Markers 27(3):e272–279CrossRefPubMed

24.

Ollier W, Sprosen T, Peakman T (2005) UK Biobank: from concept to reality. Pharmacogenomics 6(6):639–646CrossRefPubMed

25.

Plebani M, Carraro P (1997) Mistakes in a stat laboratory: types and frequency. Clin Chem 43(8 Pt 1):1348–1351PubMed

26.

Riegman PH, de Jong B, Daidone MG et al (2015) Optimizing sharing of hospital biobank samples. Sci Transl Med 7(297):297–s231CrossRef

27.

Riegman PH, Morente MM, Betsou F et al (2008) Biobanking for better healthcare. Mol Oncol 2(3):213–222CrossRefPubMedPubMedCentral

28.

Schrohl AS, Wurtz S, Kohn E et al (2008) Banking of biological fluids for studies of disease-associated protein biomarkers. Mol Cell Proteomics 7(10):2061–2066CrossRefPubMedPubMedCentral

29.

Wander K, Brindle E, O’Connor KA (2008) C‑reactive protein across the menstrual cycle. Am J Phys Anthropol 136(2):138–146CrossRefPubMed

Titel: Präanalytik und Biobanking
Einfluss präanalytischer Faktoren auf die Gewebeprobenqualität
verfasst von: K.-F. Becker
J. Wipperfürth
Prof. Dr. E. Herpel
Publikationsdatum: 04.04.2018
Verlag: Springer Medizin
Erschienen in: Die Pathologie / Ausgabe 4/2018
Print ISSN: 2731-7188
Elektronische ISSN: 2731-7196
DOI: https://doi.org/10.1007/s00292-018-0437-7

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