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Archives of Virology

Erschienen in:

01.01.2009 | Annotated Sequence Record

Sequence characterization of Dasheen mosaic virus isolates from cocoyam in Nicaragua

verfasst von: Guillermo Reyes, Jon N. E. Ramsell, Marie Nyman, Anders Kvarnheden

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 1/2009

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Abstract

Dasheen mosaic virus (DsMV) is an important constraint to production of cocoyam (Xanthosoma spp.) in Nicaragua. Reverse transcription polymerase chain reaction was used to amplify the coat protein (CP) region from ten Nicaraguan DsMV isolates. These isolates showed high nucleotide identity to DsMV isolates from the USA, eastern Asia and Australasia. All Nicaraguan isolates except one shared a tandem repeat in the N-terminus of the CP. Phylogenetic analyses showed that the Nicaraguan isolates formed two distinct subgroups correlated with geographic origin. This can be explained by different origins of the cocoyam genotypes grown in these regions.

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Titel: Sequence characterization of Dasheen mosaic virus isolates from cocoyam in Nicaragua
verfasst von: Guillermo Reyes
Jon N. E. Ramsell
Marie Nyman
Anders Kvarnheden
Publikationsdatum: 01.01.2009
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 1/2009
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-008-0257-9

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