Skip to main content
main-content

13.12.2018 | Original Article | Ausgabe 2/2019

European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 2/2019

The bacteriology in adult patients with pneumonia and parapneumonic effusions: increased yield with DNA sequencing method

Zeitschrift:
European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases > Ausgabe 2/2019
Autoren:
Niclas Johansson, Martin Vondracek, Carolina Backman-Johansson, Magnus C. Sköld, Karin Andersson-Ydsten, Jonas Hedlund
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (https://​doi.​org/​10.​1007/​s10096-018-3426-0) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Summary of the article’s main point
Among patients with parapneumonic effusions, bacteria were often detected in pleural fluid, with viridans streptococci and anaerobic species as the most frequently findings. Compared with culture, 16S rDNA sequencing improved the microbiological yield and the specificity seemed to be high.

Publisher’s note

Springer Nature remains neutral with regard to jurisdictional claims in published maps and institutional affiliations.

Abstract

The aim of this study was to use a 16S rDNA sequencing method in combination with conventional culture in patients with parapneumonic effusions (PPE) to evaluate the methods, study the microbiological spectrum, and examine the presence of bacteria within the different stages of PPE. Adults with community-acquired pneumonia (CAP) and PPE (n = 197) admitted to the Departments of Infectious Diseases at four hospitals in Stockholm County during 2011–2014 were prospectively studied. All patients underwent thoracentesis. Twenty-seven non-infectious pleural effusions were used as controls. The pleural samples were analyzed with culture, 16S rDNA sequencing, pH, glucose, and lactate dehydrogenase. Microbiological etiology was found in 99/197 (50%) of the patients with mixed infections in 20 cases. The most common pathogens were viridans streptococci (n = 37) and anaerobic bacteria (n = 40). Among the 152 patients with both methods performed, 26/152 (17%) and 94/152 (62%) had bacteria identified with culture and 16S rDNA sequencing respectively (p < 0.001). In 24/26 (92%) culture-positive cases, the same organism was identified by 16S rDNA. All controls were negative in both methods. Among the patients with complicated PPE and complete sampling, bacteria were found in 69/74 patients (93%), all detected with 16S rDNA sequencing, compared to 23/74 (31%) culture-positive samples (p < 0.001). Compared with culture, 16S rDNA sequencing substantially improved the microbiological yield, a microbiological diagnosis was achieved in almost all patients with complicated PPE, and the specificity seemed to be high. 16S rDNA sequencing should be used together with culture in patients with PPE to guide antibiotic therapy.

Bitte loggen Sie sich ein, um Zugang zu diesem Inhalt zu erhalten

★ PREMIUM-INHALT
e.Med Interdisziplinär

Mit e.Med Interdisziplinär erhalten Sie Zugang zu allen CME-Fortbildungen und Fachzeitschriften auf SpringerMedizin.de. Zusätzlich können Sie eine Zeitschrift Ihrer Wahl in gedruckter Form beziehen – ohne Aufpreis.

Weitere Produktempfehlungen anzeigen
Zusatzmaterial
ESM 1 (DOC 61 kb)
10096_2018_3426_MOESM1_ESM.doc
Literatur
Über diesen Artikel

Weitere Artikel der Ausgabe 2/2019

European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 2/2019 Zur Ausgabe
  1. Sie können e.Med Innere Medizin 14 Tage kostenlos testen (keine Print-Zeitschrift enthalten). Der Test läuft automatisch und formlos aus. Es kann nur einmal getestet werden.

Neu im Fachgebiet Innere Medizin

Meistgelesene Bücher aus der Inneren Medizin

2017 | Buch

Rheumatologie aus der Praxis

Entzündliche Gelenkerkrankungen – mit Fallbeispielen

Dieses Fachbuch macht mit den wichtigsten chronisch entzündlichen Gelenk- und Wirbelsäulenerkrankungen vertraut. Anhand von über 40 instruktiven Fallbeispielen werden anschaulich diagnostisches Vorgehen, therapeutisches Ansprechen und der Verlauf …

Herausgeber:
Rudolf Puchner

2016 | Buch

Ambulant erworbene Pneumonie

Was, wann, warum – Dieses Buch bietet differenzierte Diagnostik und Therapie der ambulant erworbenen Pneumonie zur sofortigen sicheren Anwendung. Entsprechend der neuesten Studien und Leitlinien aller wichtigen Fachgesellschaften.

Herausgeber:
Santiago Ewig

Mail Icon II Newsletter

Bestellen Sie unseren kostenlosen Newsletter Update Innere Medizin und bleiben Sie gut informiert – ganz bequem per eMail.

© Springer Medizin 

Bildnachweise