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Archives of Virology

Erschienen in:

01.07.2013 | Annotated Sequence Record

The complete genomic sequence of a novel mycovirus from Rhizoctonia solani AG-1 IA strain B275

verfasst von: Li Zheng, Huiquan Liu, Meiling Zhang, Xiong Cao, Erxun Zhou

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 7/2013

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Abstract

The complete genome of a novel mycovirus, Rhizoctonia solani dsRNA virus 1 (RsRV1) was sequenced and analyzed. It is composed of two dsRNA genome segments, 2379 bp and 1811 bp in length, which were referred to as RsRV1-1 and RsRV1-2, respectively. RsRV1-1 contains a single open reading frame (ORF1), which has a conserved RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) domain, whereas RsRV1-2 contains a single ORF2, which might encode a multifunctional protein. The genome organization of RsRV1 is similar to that of members of the family Partitiviridae. However, phylogenetic analysis indicated that RsRV1 formed a distinct clade together with three other unclassified viruses, suggesting that RsRV1 may belong to a new family of dsRNA mycoviruses. This is the first report of the full-length nucleotide sequence of a novel dsRNA mycovirus, RsRV1, infecting R. solani AG-1 IA strain B275, the causal agent of rice sheath blight.

Bharathan N, Saso H, Gudipati L, Bharathan S, Whited K, Anthony K (2005) Double-stranded RNA distribution and analysis among isolates of Rhizoctonia solani AG-2 to -13. Plant Path 54:196–203CrossRef

Carling DE (1996) Grouping in Rhizoctonia solani by hyphal anastomosis. In: Sneh, B, Jabaji-Hare S, Neate S, Dijst G (eds) Rhizoctonia species: taxonomy, molecular biology, ecology, pathology and disease control. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, The Netherlands, pp 37–47

Cold Spring Harbor Laboratory Press (2005) Rapid amplification of 5′ complementary DNA ends (5′ RACE). Nat Methods 2:629–630CrossRef

Cubeta MA, Vilgalys R (1997) Population biology of the Rhizoctonia solani complex. Phytopathology 87:480–484PubMedCrossRef

Jian J, Lakshman DK, Tavantzis SM (1997) Association of distinct double-stranded RNAs with enhanced or diminished virulence in Rhizoctonia solani infecting potato. Mol Plant-Micro Int 10:1002–1009CrossRef

Kousik C, Snow J, Valverde R (1994) Comparison of double-stranded RNA components and virulence among isolates of Rhizoctonia solani AG-1 IA and AG-1 IB. Phytopathology 84:44–49CrossRef

Liu C, Lakeshman DK, Tavantzis SM (2003) Quinic acid induces hypovirulence and expression of a hypovirulence-associated double-strand RNA in Rhizoctonia solani. Curr Genet 43:103–111PubMed

Márquez LM, Redman RS, Rodriguez RJ, Roossinck MJ (2007) A virus in a fungus in a plant: Three-way symbiosis required for thermal tolerance. Science 315:513–515PubMedCrossRef

Martin RR, Zhou J, Tzanetakis IE (2011) Blueberry latent virus: an amalgam of the Partitiviridae and Totiviridae. Virus Res 155:175–180PubMedCrossRef

10.

Morris TJ, Dodds JA (1979) Isolation and analysis of double-stranded RNA from virus-infected plant and fungal tissue. Phytopathology 69:854–858CrossRef

11.

Ogoshi A (1987) Ecology and pathogenicity of anastomosis and intraspecific groups of Rhizoctonia solani Kühn. Ann Rev Phytopath 25:125–143CrossRef

12.

Ogoshi A (1996) The genus Rhizoctonia. In: Sneh, B, Jabaji-Hare S, Neate S, Dijst G (eds) Rhizoctonia species: taxonomy, molecular biology, ecology, pathology and disease control. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, The Netherlands, pp 1–10

13.

Rong R, Rao S, Scott SW, Carner GR, Tainter FH (2002) Complete sequence of the genome of two dsRNA viruses from Discula destructive. Virus Res 90:217–224PubMedCrossRef

14.

Strauss EE, Lakshman DK, Tavantzis SM (2000) Molecular characterization of the genome of a partitivirus from the basidiomycete Rhizoctonia solani. J Gen Virol 81:549–555PubMed

15.

Tamura K, Peterson D, Stecher G, Nei M, Kumar S (2011) MEGA 5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol 28:2731–2739PubMedCrossRef

16.

Vainio EJ, Hyder R, Aday G, Hansen E, Piri T (2012) Population structure of a novel putative mycovirus infecting the conifer root-rot fungus Heterobasidium annosum sensu lato. Virology 422:366–376PubMedCrossRef

17.

Yu J, Kwon SJ, Lee KM, Son M, Kim KH (2009) Complete nucleotide sequence of double-stranded RNA viruses from Fusarium graminearum strain DK3. Arch Virol 154:1855–1858PubMedCrossRef

18.

Zanzinger DH, Bandy BP, Tavantzis SM (1984) High frequency of finding double-stranded RNA in naturally occurring isolates of Rhizoctonia solani. J Gen Virol 65:1601–1605CrossRef

Titel: The complete genomic sequence of a novel mycovirus from Rhizoctonia solani AG-1 IA strain B275
verfasst von: Li Zheng
Huiquan Liu
Meiling Zhang
Xiong Cao
Erxun Zhou
Publikationsdatum: 01.07.2013
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 7/2013
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-013-1637-3

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