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Archives of Virology
Erschienen in: Archives of Virology 11/2010

01.11.2010 | Annotated Sequence Record

The complete sequence of a UK strain of black raspberry necrosis virus

verfasst von: W. J. McGavin, L. S. McMenemy, S. A. MacFarlane

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 11/2010

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Abstract

The complete nucleotide sequence of a UK strain of the sadwavirus Black raspberry necrosis virus (BRNV) was obtained by amplification and sequencing of virus RNA from infected plants grown in a raspberry plantation in Aylth, Scotland. The RNA1 was 7,572 nucleotides (nt) in size and RNA2 was 6,350 nt in size, each excluding the 3′ poly-A tail. The RNA1- and RNA2-encoded polyproteins are predicted to be processed into (RNA1) a protease cofactor, an RNA helicase, the VpG, a 3C-like protease, an RNA-dependent RNA polymerase and an AlkB protein, and (RNA2) a movement protein and two capsid proteins.
Literatur
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Metadaten
Titel
The complete sequence of a UK strain of black raspberry necrosis virus
verfasst von
W. J. McGavin
L. S. McMenemy
S. A. MacFarlane
Publikationsdatum
01.11.2010
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 11/2010
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-010-0807-9

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