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Archives of Virology
Erschienen in: Archives of Virology 3/2012

01.03.2012 | Brief Report

Two types of defective RNAs arising from the tomato black ring virus genome

verfasst von: Beata Hasiów-Jaroszewska, Natasza Borodynko, Marek Figlerowicz, Henryk Pospieszny

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 3/2012

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Abstract

Short defective RNAs (D-RNAs) associated with tomato black ring virus (TBRV) were isolated, cloned and sequenced. As a result, two types of D-RNAs associated with different TBRV isolates were identified. Both types were derived from RNA1. The first one contained sequences from the 5′ and 3′ untranslated regions (UTR) and from the 5′ region of a single large open reading frame. The second one included a portion of the coding region for the RNA-dependent RNA polymerase flanked by a short fragment of the 5′ UTR and the entire 3′ UTR. The possible nature and origin of these RNA species is discussed.
Literatur
1.
Jończyk M, Le Gall O, Pałucha A, Borodynko N, Pospieszny H (2004) Cloning and sequencing of full-length cDNAs of RNA1 and RNA2 of a Tomato black ring virus isolate from Poland. Arch Virol 149:799–807PubMedCrossRef
2.
Robinson DJ, Barker H, Harrison BD, Mayo MA (1980) Replication of RNA 1 of tomato black ring virus independently of RNA 2. J Gen Virol 51:317–326CrossRef
3.
Oncino C, Hemmer O, Fritsch O (1995) Specificity in the association of tomato black ring virus satellite RNA with helper virus. Virology 213:87–96PubMedCrossRef
4.
Hemmer O, Oncino O, Fritsch O (1993) Efficient replication of the in vitro transcripts from cloned cDNA of tomato black ring virus satellite RNA requires the 48K satellite RNA-encoded protein. Virology 194:800–806PubMedCrossRef
5.
Jończyk M, Borodynko N, Figlerowicz M, Pospieszny H (2004) Small defective interfering RNAs arising from tomato black ring virus (TBRV) genome. FEBS J (Supplement 1 abstract number P2.2-01, p 45)
6.
Lazzarini RA, Keene JD, Schubert M (1981) The origins of defective interfering particles of negative strand viruses. Cell 26:145–154PubMedCrossRef
7.
Alejska M, Kurzyńska-Kokorniak A, Broda M, Kierzek R, Figlerowicz M (2001) How RNA viruses exchange their genetic material. Acta Bioch Pol 48:391–407
8.
Urbanowicz A, Alejska M, Formanowicz P, Błażewicz J, Figlerowicz M, Bujarski JJ (2005) Homologous crossovers among molecules of brome mosaic bromovirus RNA1 and RNA2 segments in vivo. J Virol 79:5732–5742PubMedCrossRef
9.
Figlerowicz M (2000) Role of RNA structure in non-homologous recombination between genomic molecules of brome mosaic virus. Nucleic Acid Res 28:1714–1723PubMedCrossRef
10.
Figlerowicz M, Bujarski JJ (1998) RNA recombination in brome mosaic virus, a model plus stranded RNA virus. Acta Biochim Pol 45:1–23
11.
Shapka N, Nagy P (2004) The AU-rich RNA recombination hot spot sequence of brome mosaic virus is functional in tombusviruses: implication for the mechanism of RNA recombination. J Virol 78:2288–2300PubMedCrossRef
12.
White KA, Morris TJ (1999) Defective and defective interfering RNAs of monopartite plus-strand RNA plant viruses. Curr Top Microbiol Immunol 239:1–17PubMed
13.
Roux L, Simon AE, Holland JJ (1991) Effects on defective interfering viruses on virus replication and pathogenesis in vitro and in vivo. Adv Virus Res 40:181–211PubMedCrossRef
14.
Zhang C, Simon AE (1994) Effect of template size on accumulation of defective interfering RNAs in protoplast. J Virol 68:8466–8469PubMed
15.
Havelda Z, Szittya G, Burgyan J (1998) Characterization of the molecular mechanism of defective interfering RNA-mediated symptoms attenuation in tombusvirus-infected plants. J Virol 72:6251–6256PubMed
16.
Li HX, Heaton LA, Moris JT, Simon AE (1989) Turnip crinkle virus defective interfering RNAs intensify viral symptoms and re generated de novo. PNAS 86:9173–9177PubMedCrossRef
17.
Pospieszny H, Borodynko N (1999) Methods of detection and identification of tomato black ring virus. Prog Plant Prot Res 39:327–331
18.
Le Gall O, Candresse T, Dunez J (1995) Transfer of the 3′ non-translated region of grapevine chrome mosaic virus RNA-1 by recombination to tomato black ring virus RNA-2 in pseudorecombinant isolates. J Gen Virol 76:1285–1289PubMedCrossRef
19.
Le Gall O, Lanneau M, Candresse T, Dunez J (1995) The nucleotide sequences of the RNA2 of an isolate of the English serotype of tomato black ring virus: RNA recombination in the history of nepoviruses. J Gen Virol 76:1279–1283PubMedCrossRef
20.
Kim MJ, Kao C (2001) Factors regulating template switch in vitro by viral RNA-dependent RNA polymerases: implications for RNA-RNA recombination. PNAS 98:4972–4977PubMedCrossRef
21.
Fritsch C, Koenig I, Murant AF, Raschké JH, Mayo MA (1984) Comparison among satellite species from five isolates of tomato black ring virus and one isolate of myrobalan latent ringspot virus. J Gen Virol 63:289–294CrossRef
22.
Bruyere A, Wantroba M, Flasinski S, Dzianott A, Bujarski JJ (2000) Frequent homologous recombination events between molecules of one RNA component in a multipartite RNA virus. J Virol 74:4214–4219PubMedCrossRef
23.
Karetnikov A, Keränen M, Lehto K (2006) Role of the RNA2 3′ non-translated region of blackcurrant reversion nepovirus in translational regulation. Virology 354:178–191PubMedCrossRef
Metadaten
Titel
Two types of defective RNAs arising from the tomato black ring virus genome
verfasst von
Beata Hasiów-Jaroszewska
Natasza Borodynko
Marek Figlerowicz
Henryk Pospieszny
Publikationsdatum
01.03.2012
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 3/2012
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-011-1200-z

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