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Archives of Virology
Erschienen in: Archives of Virology 10/2016

09.07.2016 | Brief Report

Whole genomic characterization of Korean porcine G8P[7] reassortant rotaviruses

verfasst von: Jun-Gyu Park, Sang-Ik Park, Nam-Il Woo, Deok-Song Kim, Ja-Young Seo, Mia Madel Alfajaro, Ji-Yun Kim, Mahmoud Soliman, Yeong-Bin Baek, Eun-Hyo Cho, Joseph Kwon, Jong-Soon Choi, Mun-Il Kang, Jelle Matthijnssens, Kyoung-Oh Cho

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 10/2016

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Abstract

This study analyzed eleven genomic segments of three Korean porcine G8P[7] group A rotavirus (RVA) strains. Phylogenetically, these strains contained two bovine-like and nine porcine-like genomic segments. Eight genes (VP1, VP2, VP6 and NSP1-NSP5) of strains 156-1 and 42-1 and seven genes (VP1, VP2, VP6 and NSP2-NSP5) of strain C-1 clustered closely with porcine and porcine-like animal strains and distantly from typical human Wa-like strains. The VP3-M2 genotype of these strains clustered closely with bovine-like strains, but distantly with typical human DS-1-like strains. These data indicate that multiple reassortments involving porcine and bovine RVA strains in Korea must have occurred.
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Metadaten
Titel
Whole genomic characterization of Korean porcine G8P[7] reassortant rotaviruses
verfasst von
Jun-Gyu Park
Sang-Ik Park
Nam-Il Woo
Deok-Song Kim
Ja-Young Seo
Mia Madel Alfajaro
Ji-Yun Kim
Mahmoud Soliman
Yeong-Bin Baek
Eun-Hyo Cho
Joseph Kwon
Jong-Soon Choi
Mun-Il Kang
Jelle Matthijnssens
Kyoung-Oh Cho
Publikationsdatum
09.07.2016
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 10/2016
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-016-2945-1

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