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Archives of Virology

Erschienen in:

01.12.2011 | Brief Report

Analysis of the complete DNA sequence of rice tungro bacilliform virus from southern India indicates it to be a product of recombination

verfasst von: S. Sharma, R. Rabindran, S. Robin, I. Dasgupta

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 12/2011

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Abstract

The complete nucleotide sequence of an isolate of rice tungro bacilliform virus (RTBV), collected from Kanyakumari, India, where RTBV was reported recently for the first time, has been analyzed. Sequence comparison revealed that the RTBV isolate from Kanyakumari (RTBV-KK) has a high degree of identity to the two previously reported RTBV sequences from India, RTBV-AP and RTBV-WB, which had been collected from field locations about 10 years ago and 1000–2000 km away from the collection site of RTBV-KK. Most of the sequence domains reported previously in other RTBV isolates were found to be conserved in RTBV-KK. Closer inspection revealed RTBV-KK to be a possible recombinant between RTBV-AP and RTBV-WB in the genomic region encompassing the coat protein gene.

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Titel: Analysis of the complete DNA sequence of rice tungro bacilliform virus from southern India indicates it to be a product of recombination
verfasst von: S. Sharma
R. Rabindran
S. Robin
I. Dasgupta
Publikationsdatum: 01.12.2011
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 12/2011
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-011-1092-y

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