Skip to main content
Erschienen in: Archives of Virology 12/2022

18.10.2022 | Annotated Sequence Record

Characterization of a novel victorivirus from Nigrospora chinensis, a fungus isolated from tobacco

verfasst von: Jie Zhong, Wen Wen Sui, Ping Li, Qian Jun Tang, Tian Bo Liu, Yan Song Xiao

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 12/2022

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

Here, we characterized a new mycovirus from the fungus Nigrospora chinensis, which was named "Nigrospora chinensis victorivirus 1" (NcVV1). The NcVV1 genome is 5283 bp in length, containing two continuous open reading frames (ORFs), ORF1 and ORF2. ORF1 and ORF2 were predicted to encode a putative coat protein (CP) and an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), respectively. The stop codon of ORF1 overlaps with the start codon of ORF2 by the tetranucleotide sequence AUGA. Phylogenetic analysis based on amino acid sequences of RdRp and CP indicated that NcVV1 clustered with members of the genus Victorivirus in the family Totiviridae. To our knowledge, this was the first report of a mycovirus infecting N. chinensis.
Anhänge
Nur mit Berechtigung zugänglich
Literatur
1.
Zurück zum Zitat Xie J, Jiang D (2014) New insights into mycoviruses and exploration for the biological control of crop fungal diseases. Annu Rev Phytopathol 52:45–68CrossRef Xie J, Jiang D (2014) New insights into mycoviruses and exploration for the biological control of crop fungal diseases. Annu Rev Phytopathol 52:45–68CrossRef
2.
Zurück zum Zitat Kotta-Loizou I (2021) Mycoviruses and their role in fungal pathogenesis. Curr Opin Microbiol 63:10–18CrossRef Kotta-Loizou I (2021) Mycoviruses and their role in fungal pathogenesis. Curr Opin Microbiol 63:10–18CrossRef
3.
Zurück zum Zitat Myers JM, Bonds AE, Clemons RA, Thapa NA, Simmons DR, Carter-House D, Ortanez J, Liu P, Miralles-Durán A, Desirò A, Longcore JE, Bonito G, Stajich JE, Spatafora JW, Chang Y, Corrochano LM, Gryganskyi A, Grigoriev IV, James TY (2020) Survey of early-diverging lineages of fungi reveals abundant and diverse mycoviruses. mBiol 11:e02027 Myers JM, Bonds AE, Clemons RA, Thapa NA, Simmons DR, Carter-House D, Ortanez J, Liu P, Miralles-Durán A, Desirò A, Longcore JE, Bonito G, Stajich JE, Spatafora JW, Chang Y, Corrochano LM, Gryganskyi A, Grigoriev IV, James TY (2020) Survey of early-diverging lineages of fungi reveals abundant and diverse mycoviruses. mBiol 11:e02027
4.
Zurück zum Zitat Li H, Havens WM, Nibert ML, Ghabrial SA (2011) RNA sequence determinants of a coupled termination-reinitiation strategy for downstream open reading frame translation in Helminthosporium victoriae virus 190S and other victoriviruses (Family Totiviridae). J Virol 85:7343–7352CrossRef Li H, Havens WM, Nibert ML, Ghabrial SA (2011) RNA sequence determinants of a coupled termination-reinitiation strategy for downstream open reading frame translation in Helminthosporium victoriae virus 190S and other victoriviruses (Family Totiviridae). J Virol 85:7343–7352CrossRef
5.
Zurück zum Zitat Wang M, Liu F, Crous P, Cai L (2017) Phylogenetic reassessment of Nigrospora: ubiquitous endophytes, plant and human pathogens. Persoonia 39:118–142CrossRef Wang M, Liu F, Crous P, Cai L (2017) Phylogenetic reassessment of Nigrospora: ubiquitous endophytes, plant and human pathogens. Persoonia 39:118–142CrossRef
6.
Zurück zum Zitat Lee DJ, Lee JS, Lee HB, Choi YJ (2019) Four endophytic Ascomycetes new to korea: Cladosporium anthropophilum, C. pseudocladosporioides, Daldinia eschscholtzii, and Nigrospora chinensis. Kor J Mycol 47:187–197 Lee DJ, Lee JS, Lee HB, Choi YJ (2019) Four endophytic Ascomycetes new to korea: Cladosporium anthropophilum, C. pseudocladosporioides, Daldinia eschscholtzii, and Nigrospora chinensis. Kor J Mycol 47:187–197
7.
Zurück zum Zitat Zhou Q, Zhong J, Hu Y, Gao BD (2016) A novel nonsegmented double-stranded RNA mycovirus identified in the phytopathogenic fungus Nigrospora oryzae shows similarity to partitivirus-like viruses. Arch Virol 161:229–232CrossRef Zhou Q, Zhong J, Hu Y, Gao BD (2016) A novel nonsegmented double-stranded RNA mycovirus identified in the phytopathogenic fungus Nigrospora oryzae shows similarity to partitivirus-like viruses. Arch Virol 161:229–232CrossRef
8.
Zurück zum Zitat Zhong J, Zhao SQ, Li GF, Pang XD, Deng XJ, Zhu HJ, Gao BD, Zhou Q (2016) A novel fusarivirus isolated from the phytopathogenic fungus Nigrospora oryzae. Virus Genes 52:891–895CrossRef Zhong J, Zhao SQ, Li GF, Pang XD, Deng XJ, Zhu HJ, Gao BD, Zhou Q (2016) A novel fusarivirus isolated from the phytopathogenic fungus Nigrospora oryzae. Virus Genes 52:891–895CrossRef
9.
Zurück zum Zitat Zhong J, Zhou Q, Hu Y, Zhu HJ, Gao BD (2016) Molecular identification of a novel victorivirus from the phytopathogenic fungus Nigrospora oryzae. Virus Genes 52:156–159CrossRef Zhong J, Zhou Q, Hu Y, Zhu HJ, Gao BD (2016) Molecular identification of a novel victorivirus from the phytopathogenic fungus Nigrospora oryzae. Virus Genes 52:156–159CrossRef
10.
Zurück zum Zitat Liu H, Liu R, Li CX, Wang H, Zhu HJ, Gao BD, Zhou Q, Zhong J (2019) A Victorivirus and two novel Mitoviruses co-infected the plant pathogen Nigrospora oryzae. Viruses 11:83CrossRef Liu H, Liu R, Li CX, Wang H, Zhu HJ, Gao BD, Zhou Q, Zhong J (2019) A Victorivirus and two novel Mitoviruses co-infected the plant pathogen Nigrospora oryzae. Viruses 11:83CrossRef
11.
Zurück zum Zitat Hu Z, Guo J, Gao BD, Zhong J (2020) A novel mycovirus isolated from the plant-pathogenic fungus Alternaria dianthicola. Arch Virol 165:2105–2109CrossRef Hu Z, Guo J, Gao BD, Zhong J (2020) A novel mycovirus isolated from the plant-pathogenic fungus Alternaria dianthicola. Arch Virol 165:2105–2109CrossRef
12.
Zurück zum Zitat Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S (2013) MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 30:2725–2729CrossRef Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S (2013) MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 30:2725–2729CrossRef
13.
Zurück zum Zitat Routhier E, Bruenn JA (1998) Functions of conserved motifs in the RNA-dependent RNA polymerase of a yeast double-stranded RNA virus. J Virol 72:4427–4429CrossRef Routhier E, Bruenn JA (1998) Functions of conserved motifs in the RNA-dependent RNA polymerase of a yeast double-stranded RNA virus. J Virol 72:4427–4429CrossRef
14.
Zurück zum Zitat Wickner RB, Ghabrial SA, Nibert ML, Patterson JL, Wang CC (2011) Family Totiviridae. In: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowits EJ (eds) Virus taxonomy: ninth report of the international committee for the taxonomy of viruses. Elsevier, Academic Press, New York, pp 639–650 Wickner RB, Ghabrial SA, Nibert ML, Patterson JL, Wang CC (2011) Family Totiviridae. In: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowits EJ (eds) Virus taxonomy: ninth report of the international committee for the taxonomy of viruses. Elsevier, Academic Press, New York, pp 639–650
15.
Zurück zum Zitat Khan HA, Sato Y, Kondo H, Jamal A, Bhatti MF, Suzuki N (2022) A novel victorivirus from the phytopathogenic fungus Neofusicoccum parvum. Arch Virol 167:923–929CrossRef Khan HA, Sato Y, Kondo H, Jamal A, Bhatti MF, Suzuki N (2022) A novel victorivirus from the phytopathogenic fungus Neofusicoccum parvum. Arch Virol 167:923–929CrossRef
Metadaten
Titel
Characterization of a novel victorivirus from Nigrospora chinensis, a fungus isolated from tobacco
verfasst von
Jie Zhong
Wen Wen Sui
Ping Li
Qian Jun Tang
Tian Bo Liu
Yan Song Xiao
Publikationsdatum
18.10.2022
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 12/2022
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-022-05619-z

Weitere Artikel der Ausgabe 12/2022

Archives of Virology 12/2022 Zur Ausgabe

Leitlinien kompakt für die Innere Medizin

Mit medbee Pocketcards sicher entscheiden.

Seit 2022 gehört die medbee GmbH zum Springer Medizin Verlag

Alphablocker schützt vor Miktionsproblemen nach der Biopsie

16.05.2024 alpha-1-Rezeptorantagonisten Nachrichten

Nach einer Prostatabiopsie treten häufig Probleme beim Wasserlassen auf. Ob sich das durch den periinterventionellen Einsatz von Alphablockern verhindern lässt, haben australische Mediziner im Zuge einer Metaanalyse untersucht.

Eingreifen von Umstehenden rettet vor Erstickungstod!

15.05.2024 Fremdkörperaspiration Nachrichten

Wer sich an einem Essensrest verschluckt und um Luft ringt, benötigt vor allem rasche Hilfe. Dass Umstehende nur in jedem zweiten Erstickungsnotfall bereit waren, diese zu leisten, ist das ernüchternde Ergebnis einer Beobachtungsstudie aus Japan. Doch es gibt auch eine gute Nachricht.

Neue S3-Leitlinie zur unkomplizierten Zystitis: Auf Antibiotika verzichten?

15.05.2024 Harnwegsinfektionen Nachrichten

Welche Antibiotika darf man bei unkomplizierter Zystitis verwenden und wovon sollte man die Finger lassen? Welche pflanzlichen Präparate können helfen? Was taugt der zugelassene Impfstoff? Antworten vom Koordinator der frisch überarbeiteten S3-Leitlinie, Prof. Florian Wagenlehner.

Schadet Ärger den Gefäßen?

14.05.2024 Arteriosklerose Nachrichten

In einer Studie aus New York wirkte sich Ärger kurzfristig deutlich negativ auf die Endothelfunktion gesunder Probanden aus. Möglicherweise hat dies Einfluss auf die kardiovaskuläre Gesundheit.

Update Innere Medizin

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.